LbuCas13a属于Ⅱ类Ⅵ型CRISPR系统效应蛋白,是由crRNA介导的核酸内切酶,在识别并切割靶标RNA时,其“附属切割”活性被激活,可非特异切割体系中单链 RNA(ssRNA)。
LbuCas13a Nuclease说明书
【产品名称】LbuCas13a Nuclease 【分子量】141.6KDa
【产品编号】EDE0002 【形式】液体
【产品简介】
LbuCas13a(又名C2c2)来源于Leptotrichia buccalis菌株。LbuCas13a属于Ⅱ类Ⅵ型CRISPR系统效应蛋白,是由crRNA介导的核酸内切酶,在识别并切割靶标RNA时,其“附属切割”活性被激活,可非特异切割体系中单链 RNA(ssRNA)。通过设计两端标记荧光基团或者其他标记物的RNA探针,可实现CRISPR/Cas13a对RNA模板的检测和信号放大。可通过荧光仪或试纸观察结果。
【产品组分】
组分 |
EDE0002-100 |
EDE0002-500 |
EDE0002-1000 |
LbuCas13a Nuclease |
5 μM*20 μL (100 pmol) |
5 μM*100 μL (500 pmol) |
5 μM*200 μL (1000 pmol) |
LbuCas13a Cleavage Buffer(5×) |
500 μL*1管 |
500 μL*4管 |
1mL*4管 |
【储存条件及有效期】
有效期1年,保存条件-20°C;如长期储存,建议置于-80°C。
建议根据使用次数进行分装,避免反复冻融。
【产品特点】
采用一步法纯化制备,最大程度保留酶活性,经过测试酶活性显著高于同类产品。
【活性定义】
在总体积为25 μL的反应体系中,37℃反应条件下,1 min内剪切1 pmol ssRNA探针所需的Cas13a酶量定义为1 transU。
例:若某批次 LbuCas13a酶的反式切割活性为9 transU/pmol,则表明1 pmol的该批次LbuCas13a酶可在1 min内,在上述指定的反应条件下,反式切割9 pmol ssRNA探针。
【质量保证】
样品纯度:~95% (SDS-PAGE鉴定)。
【检测步骤】
需要准备的其它试剂
1. Reporter:Cas13a 切割底物。即在剪切反应体系中加入ssRNA报告探针,该探针5′端标记荧光报告基团(FAM),3′端标记荧光淬灭基团(BHQ1)。可搭配我司的Reporter进行检测,或自行设计合成 Reporter。
产品名称 |
编号 |
ssRNA reporter(RNA探针) |
EDR0001 |
2. crRNA/gRNA:与Cas13a结合,形成功能复合物,被目标序列特异性激活。可选择我司的crRNA或自行设计合成crRNA。
名称 |
规格 |
编号 |
crRNA生物合成 |
2OD |
EDR0002 |
crRNA化学合成 |
2OD |
EDR0003 |
免费设计咨询:info@edgene.cn
3. RNase Inhibitor (可选):抑制RNase,防止RNA降解。(货号:AI101-02)
4. 恒温扩增反应试剂盒。
【测试反应体系】
组分 |
体积/ μL |
终浓度 |
5 μM LbuCas13a |
0.25 |
50 nM |
5×Cleavage Buffer |
5 |
1× |
25 U RNase Inhibitor |
1 |
1 U |
500 nM crRNA |
2.5 |
50 nM |
4 μM ssRNA Reporter |
2.5 |
400 nM |
1 μM RNA target |
1.25 |
50 nM |
H2O |
- |
- |
Total |
25μL |
25μL |
【反应条件】
实时荧光定量PCR仪或恒温扩增仪检测荧光信号,37℃反应,每 30 sec 采集一次荧光信号。
【酶活性对比实验结果】
Fig 1. Results of Cas13 collateral cleavage at different concentration.
横坐标为反应时间,纵坐标为苏州克睿MA-1610恒温扩增仪检测结果。由图可见,5×10^9拷贝靶标RNA可高效激活LbuCas13a酶,10分钟内可完全切割RNA报告探针,并达到荧光峰值。
【注意事项】
1. 为防止 RNase 污染,请保持实验区干净整洁,操作时需穿戴干净的手套、口罩,实验所用枪头、离心管等耗材均为 RNase-free。
2. Cas13a 酶对热敏感,容易失活,应全程冰上配置反应体系,并在使用后立即将酶置于-20℃保存。