Flash-KO 技术平台

技术平台简介

基因敲除细胞系构建技术平台——高效、精准、稳定

艾迪基因可为科研及工业客户提供专业基因敲除细胞系构建服务,依托优化 CRISPR 编辑技术、多元递送方案与高精度筛选体系,攻克原代细胞、干细胞、类器官等难转染细胞的编辑难题。

基因编辑的核心瓶颈在于高效低毒的细胞递送。公司自研FLASH 广谱基因编辑递送平台,通过蛋白 / 核酸共递送载体,实现 RNP 复合物高效递送,兼顾低毒性与高编辑效率;搭配全流程标准化服务,保障交付细胞系遗传背景均一。

目前 FLASH 系统已适配 400 + 细胞系,成功构建了超过4500种基因敲除细胞模型,这些模型已被制药公司和研究机构广泛应用于功能基因组学、遗传疾病机制研究、药物靶点验证以及合成生物学工程等领域。

核心技术优势

1) 广谱高效:已成功覆盖400余种细胞系,53%的细胞系通过基因组测检测到敲除效率突破80%,尤其擅长iPSC、hESC、类器官及免疫细胞等传统技术难以转染的细胞类型;

2) 已验证的全基因组sgRNA:结合数千例项目经验,独创sgRNA设计逻辑,具有经过实验验证的全基因组sgRNA;

3) 细胞筛选无忧:采用德国cytena公司顶级3D细胞打印系统UP.SIGHT,高效挑选阳性单克隆;

4) 极低细胞毒性:采用创新蛋白递送系统,彻底规避DNA质粒导致的免疫原性反应与随机整合风险,转染后24-48h细胞存活率保持在90%以上;

5) 周期缩短:FLASH-KO技术无需进行抗性筛选,极限周期缩短至5周。

FLASH-KO vs. 传统递送方法
对比维度 FLASH-KO (RNP递送) 慢病毒/AAV 电转 脂质体转染
核心原理 递送预组装的Cas9蛋白+sgRNA复合物(RNP) 病毒介导,将CRISPR组分整合至宿主基因组 高压电脉冲使细胞膜穿孔,导入RNP或DNA 脂质体包裹核酸,通过膜融合或内吞进入细胞
编辑效率 极高
53%细胞系敲除效率>80%
88%细胞系敲除效率>30%
中等
稳定表达Cas9可提高效率
中等偏高
敲除30-70%
中等偏低
敲除30-70%
敲入<10%
细胞毒性 极低
转染后细胞活力>90%
中等
随机整合有致突变风险

电穿孔死亡率可达30-50%
中等
对部分细胞毒性较大
实验周期
即用型,无需病毒包装
最快5周获得纯合克隆

慢病毒包装需2-3周
AAV生产更久

数小时完成递送

数小时完成递送
适用细胞范围 极广
已验证400+细胞系
擅长iPSC、类器官、免疫细胞等
受限
AAV容量小(SpCas9装不下)
原代T细胞效率低
普遍适用
对神经元等效率低
参数需优化
受限
干细胞/悬浮细胞效率极低
非所有细胞适用
安全风险 极低
无外源DNA整合
无整合风险

随机整合至宿主基因组
极低
瞬时表达,无整合风险

瞬时表达,无整合风险

服务类型

1) 单基因敲除

2) 多基因敲除

3) 片段敲除

技术流程

技术流程

成功案例

案例一:部分细胞系高效敲除数据展示

为验证FLASH系统的广谱适用性与高效性,我们选取了近百株不同组织来源、不同物种的细胞系进行基因敲除测试,涵盖肿瘤细胞、正常永生化细胞、干细胞、免疫细胞、类器官等类型。结果显示:

✓ 53% 的细胞系敲除效率 >80%
✓ 88% 的细胞系敲除效率 >30%
✓ 即使在iPSC、hESC、原代T细胞、类器官等传统难转染细胞中,敲除效率也显著优于传统方法。

案例一

案例二:iPSC (CIITA、B2M) 双基因敲除

➢ 挑战:iPSC难转染,传统方法效率<5%

➢ 方案:采用FLASH共递送两个sgRNA

➢ 成果:CIITA基因编辑效率达到81%,B2M基因靶点效率达到71%,8周获得纯合双敲除单克隆株,多能性未受影响。

案例二-1

案例二-2

案例三:Huh6细胞基因片段敲除

➢ 挑战:精确删除较大基因组区域(通常为几百到几千个碱基对),移除基因的关键外显子或功能域。

➢ 方案:采用FLASH-KO共递送多条sgRNA,实现精确删除

➢ 成果:仅用8周,成功在Huh6细胞中实现精确小片段敲除。

案例三

案例四:基于Flash-KO平台构建在IPSC细胞中三基因共敲除细胞模型

本案例基于艾迪基因Flash-KO 基因敲除平台 ,将RNP直接导入人诱导多能干细胞(iPSC),实现3个基因的同步敲除,每个基因的敲除效率均达到50%以上。

三代测序结果KO效率展示

案例四-1

案例四-2

案例四-3


实验数据统计分析
累计覆盖52种细胞系、860+ KO基因编辑案例及近350个靶基因的实验数据,我们对主要细胞系的基因编辑成功率进行了系统分析,结果如下:

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