单细胞基因编辑技术平台

技术平台介绍

单细胞基因编辑技术平台:基因敲除克隆一步到位,极致高效

传统基因编辑细胞系构建流程通常需要经历多克隆池筛选→阳性单克隆筛选→单克隆扩增的漫长过程,周期长达10-14周,且多克隆筛选阶段可能存在优势克隆偏移,影响最终细胞系的代表性。
艾迪基因突破性地开发了单细胞基因编辑技术平台,将单细胞铺板、单细胞培养与基因编辑深度融合。通过德国Cytena UP.SIGHT系统将单个细胞精准铺板至96孔板,结合自研CFM促克隆药物显著提升单细胞克隆形成效率,再搭配Flash-KO方法在单细胞水平实现基因敲除,一步获得单细胞来源的基因编辑细胞系,彻底跳过传统多克隆筛选环节,周期缩短至6-8周。
核心技术优势
UP.SIGHT单细胞铺板:
德国Cytena顶级的3D细胞打印系统,单细胞铺板准确率>99%,确保单克隆源性;
CFM促克隆药物:
自研药物,促进单细胞贴壁与生长,显著提高克隆形成效率;
FLASH递送方法:
在单细胞水平直接进行基因编辑,无需等待细胞扩增,一步获得编辑成功的单克隆,纯合单克隆敲除成功率60-80%。
周期短:
彻底跳过传统多克隆筛选环节,周期缩短至6-8周,较常规方法缩短30%。
单细胞基因编辑 vs. 传统流程:全面领先
对比维度 传统有限稀释法 电转/病毒转染+筛选 单细胞基因编辑平台
单克隆获取方式 人工有限稀释,随机性强,易出现多克隆混合 多克隆池筛选后有限稀释,步骤繁琐 UP.SIGHT精准铺板,单细胞准确率>99%
是否需多轮筛选 是(2-3轮) 是(抗性筛选+有限稀释) 否:一步获得单克隆
周期 12-20周 14-18周 8-10周(缩短30%)
单克隆形成效率 10-30%(依赖细胞系) 10-30% 31-62%(293T达62.5%,HeLa 31.25%)
单克隆敲除成功率 30-50% 40-60% 60-100%(HeLa 100%,293T 80%)
细胞损伤 低(但多次传代) 高(电转、筛选损伤) 低(原位转染,无需消化)
自动化程度 人工操作,批间差异大 半自动 全自动(UP.SIGHT图像识别+分配)
适用细胞类型 常规贴壁细胞 较广 广,覆盖贴壁细胞+悬浮细胞
服务类型

相关服务

服务类型 技术方案 适用场景 交付内容 周期
单基因敲除(标准) UP.SIGHT铺板 + CFM促克隆 + FLASH-RNP 常规贴壁/悬浮细胞系单基因敲除 纯合单克隆细胞系(≥2株)+ 测序报告 + 克隆图像 8-10周
多基因共敲除 同时递送多个sgRNA,单细胞铺板筛选 双基因/三基因联合敲除(如免疫检查点组合) 纯合多敲单克隆细胞系 + 验证报告 10-12周
高通量阵列式敲除 96孔板预设计sgRNA文库 + 自动化铺板与转染 全基因组筛选、药物靶点筛选、信号通路解析 每孔单克隆细胞系(可选pool或克隆) 12-16周
点突变(定制) 单细胞铺板 + FLASH-PE7先导编辑 单碱基替换、小片段插入/删除(如疾病点突变模型) 纯合点突变单克隆细胞系 + 测序报告 12-16周
基因敲入(定制) 单细胞铺板 + FLASH-KI(RNP+Donor)+ NHEJ抑制 报告基因敲入、标签插入、条件性等位基因 纯合敲入单克隆细胞系 + 测序/流式报告 12-16周
成功案例
  1. 293T B2M基因敲除——高效获得48个纯合单克隆

  2. 目标:在293T细胞中构建B2M基因敲除细胞系
    方案:UP.SIGHT单细胞铺板 → CFM促克隆培养 → FLASH-KO方法转染
    结果:96孔板中克隆形成效率62.5%,获得纯合敲除单克隆成功率为80%,项目周期缩短2-3周。

A549、HeLa B2M基因敲除——100%敲除成功率

  1. 目标:在A549和HeLa细胞系中构建B2M基因敲除细胞系
    方案:UP.SIGHT单细胞铺板 → CFM促克隆培养 →  FLASH-KO方法转染
    结果:96孔板中形成38、65个克隆,获得纯合敲除单克隆成功率为成功率100%,无需额外筛选,一步获得高质量细胞系。

HAP1 96个不同基因敲除——高通量验证

  1. 目标:在HAP1细胞中同时构建96个不同基因的敲除细胞系
    方案:96孔板单细胞铺板 → 针对不同基因的 FLASH-KO方法转染
    结果:96孔中克隆形成70个(形成效率72.9%);纯合敲除单克隆42个(成功率60%);证明平台在高通量基因编辑中的可靠性。

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