单细胞基因编辑技术平台
技术平台介绍
单细胞基因编辑技术平台:基因敲除克隆一步到位,极致高效
传统基因编辑细胞系构建流程通常需要经历多克隆池筛选→阳性单克隆筛选→单克隆扩增的漫长过程,周期长达10-14周,且多克隆筛选阶段可能存在优势克隆偏移,影响最终细胞系的代表性。
艾迪基因突破性地开发了单细胞基因编辑技术平台,将单细胞铺板、单细胞培养与基因编辑深度融合。通过德国Cytena UP.SIGHT系统将单个细胞精准铺板至96孔板,结合自研CFM促克隆药物显著提升单细胞克隆形成效率,再搭配Flash-KO方法在单细胞水平实现基因敲除,一步获得单细胞来源的基因编辑细胞系,彻底跳过传统多克隆筛选环节,周期缩短至6-8周。
核心技术优势
UP.SIGHT单细胞铺板:
德国Cytena顶级的3D细胞打印系统,单细胞铺板准确率>99%,确保单克隆源性;
CFM促克隆药物:
自研药物,促进单细胞贴壁与生长,显著提高克隆形成效率;
自研药物,促进单细胞贴壁与生长,显著提高克隆形成效率;
FLASH递送方法:
在单细胞水平直接进行基因编辑,无需等待细胞扩增,一步获得编辑成功的单克隆,纯合单克隆敲除成功率60-80%。
在单细胞水平直接进行基因编辑,无需等待细胞扩增,一步获得编辑成功的单克隆,纯合单克隆敲除成功率60-80%。
周期短:
彻底跳过传统多克隆筛选环节,周期缩短至6-8周,较常规方法缩短30%。
彻底跳过传统多克隆筛选环节,周期缩短至6-8周,较常规方法缩短30%。
单细胞基因编辑 vs. 传统流程:全面领先
| 对比维度 | 传统有限稀释法 | 电转/病毒转染+筛选 | 单细胞基因编辑平台 |
| 单克隆获取方式 | 人工有限稀释,随机性强,易出现多克隆混合 | 多克隆池筛选后有限稀释,步骤繁琐 | UP.SIGHT精准铺板,单细胞准确率>99% |
| 是否需多轮筛选 | 是(2-3轮) | 是(抗性筛选+有限稀释) | 否:一步获得单克隆 |
| 周期 | 12-20周 | 14-18周 | 8-10周(缩短30%) |
| 单克隆形成效率 | 10-30%(依赖细胞系) | 10-30% | 31-62%(293T达62.5%,HeLa 31.25%) |
| 单克隆敲除成功率 | 30-50% | 40-60% | 60-100%(HeLa 100%,293T 80%) |
| 细胞损伤 | 低(但多次传代) | 高(电转、筛选损伤) | 低(原位转染,无需消化) |
| 自动化程度 | 人工操作,批间差异大 | 半自动 | 全自动(UP.SIGHT图像识别+分配) |
| 适用细胞类型 | 常规贴壁细胞 | 较广 | 广,覆盖贴壁细胞+悬浮细胞 |
服务类型
相关服务
| 服务类型 | 技术方案 | 适用场景 | 交付内容 | 周期 |
| 单基因敲除(标准) | UP.SIGHT铺板 + CFM促克隆 + FLASH-RNP | 常规贴壁/悬浮细胞系单基因敲除 | 纯合单克隆细胞系(≥2株)+ 测序报告 + 克隆图像 | 8-10周 |
| 多基因共敲除 | 同时递送多个sgRNA,单细胞铺板筛选 | 双基因/三基因联合敲除(如免疫检查点组合) | 纯合多敲单克隆细胞系 + 验证报告 | 10-12周 |
| 高通量阵列式敲除 | 96孔板预设计sgRNA文库 + 自动化铺板与转染 | 全基因组筛选、药物靶点筛选、信号通路解析 | 每孔单克隆细胞系(可选pool或克隆) | 12-16周 |
| 点突变(定制) | 单细胞铺板 + FLASH-PE7先导编辑 | 单碱基替换、小片段插入/删除(如疾病点突变模型) | 纯合点突变单克隆细胞系 + 测序报告 | 12-16周 |
| 基因敲入(定制) | 单细胞铺板 + FLASH-KI(RNP+Donor)+ NHEJ抑制 | 报告基因敲入、标签插入、条件性等位基因 | 纯合敲入单克隆细胞系 + 测序/流式报告 | 12-16周 |
成功案例
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293T B2M基因敲除——高效获得48个纯合单克隆
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目标:在293T细胞中构建B2M基因敲除细胞系方案:UP.SIGHT单细胞铺板 → CFM促克隆培养 → FLASH-KO方法转染结果:96孔板中克隆形成效率62.5%,获得纯合敲除单克隆成功率为80%,项目周期缩短2-3周。
A549、HeLa B2M基因敲除——100%敲除成功率
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目标:在A549和HeLa细胞系中构建B2M基因敲除细胞系方案:UP.SIGHT单细胞铺板 → CFM促克隆培养 → FLASH-KO方法转染结果:96孔板中形成38、65个克隆,获得纯合敲除单克隆成功率为成功率100%,无需额外筛选,一步获得高质量细胞系。
HAP1 96个不同基因敲除——高通量验证
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目标:在HAP1细胞中同时构建96个不同基因的敲除细胞系方案:96孔板单细胞铺板 → 针对不同基因的 FLASH-KO方法转染结果:96孔中克隆形成70个(形成效率72.9%);纯合敲除单克隆42个(成功率60%);证明平台在高通量基因编辑中的可靠性。