ABCA13基因|基因功能、疾病关联、突变与表达研究
ABCA13是ATP结合盒转运蛋白家族成员,参与脂质转运和细胞膜稳态,其突变与精神分裂症、自闭症等神经精神疾病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | ABCA13 |
|---|---|
| 基因全名 | ATP binding cassette subfamily A member 13 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 7p12.3 |
| NCBI Gene ID | 154664 ncbi.nlm.nih.gov/gene/154664 |
| Ensembl ID | ENSG00000179869 |
| UniProt ID | Q86UQ4 |
| OMIM ID | 607807 |
| HGNC ID | 13938 |
| 基因别名 | FLJ33985, MGC163417 |
基因功能与研究简介
ABCA13(ATP结合盒亚家族A成员13)是ATP结合盒(ABC)转运蛋白超家族的成员,该家族蛋白通常参与各种分子跨膜转运。ABCA13被认为参与脂质转运和细胞膜稳态,但其具体功能尚未完全阐明。研究表明ABCA13在脑组织中高表达,尤其在神经元中,提示其在神经系统中的重要作用。ABCA13基因突变与多种神经精神疾病相关,包括精神分裂症、双相情感障碍和自闭症谱系障碍。此外,ABCA13在多种癌症中表达异常,可能参与肿瘤发生发展。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 精神分裂症 | ABCA13基因突变可能影响神经元脂质代谢和膜功能,导致神经递质传递异常,增加精神分裂症风险。 | 较强研究证据 |
| 双相情感障碍 | ABCA13变异与双相情感障碍关联,可能通过影响神经元可塑性参与疾病发生。 | 较强研究证据 |
| 自闭症谱系障碍 | ABCA13突变在自闭症患者中被发现,可能通过影响突触功能参与疾病。 | 较强研究证据 |
| 癌症 | ABCA13在多种癌症中表达异常,可能通过调节脂质代谢影响肿瘤生长和转移。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| SH-SY5Y | 暂无可靠数据 | 神经母细胞瘤细胞系 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 人胚肾细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1234C>T (p.Arg412Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.4567A>G (p.Ile1523Val) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能 |
| c.7890del (p.Leu2630TrpfsTer3) | 移码突变 | 罕见 | Loss of Function |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能缺失突变,导致ABCA13蛋白功能丧失或减弱,可能影响脂质转运和细胞膜稳态。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明ABCA13存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明ABCA13存在显性负性突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005524 (ATP binding) | • GO:0016887 (ATP hydrolysis activity) |
| • GO:0005548 (phospholipid transporter activity) | • GO:0016020 (membrane) |
| • GO:0005886 (plasma membrane) | • GO:0005737 (cytoplasm) |
相关通路
• 暂无明确Pathway ID
蛋白质功能简介
ABCA13蛋白属于ABC转运蛋白超家族,包含两个跨膜结构域和两个核苷酸结合结构域。该蛋白可能参与脂质转运和细胞膜稳态,尤其在脑组织中高表达。ABCA13在神经元中可能参与突触传递和神经可塑性。其突变与神经精神疾病相关,但具体分子机制尚需进一步研究。