ABCD3基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

ABCD3编码过氧化物酶体膜上的ATP结合盒转运蛋白D3,参与极长链脂肪酸的β-氧化,其缺陷与过氧化物酶体生物发生障碍相关。

基因信息卡

基因符号 ABCD3
基因全名 ATP binding cassette subfamily D member 3
基因类型 protein-coding
染色体位置 1p21.3
NCBI Gene ID 5825 ncbi.nlm.nih.gov/gene/5825
Ensembl ID ENSG00000117528
UniProt ID P28288
OMIM ID 170995
HGNC ID 71
基因别名 ABC43, PMP69, PXMP1

基因功能与研究简介

ABCD3基因编码ATP结合盒(ABC)转运蛋白超家族D亚家族的成员3,该蛋白定位于过氧化物酶体膜,参与极长链脂肪酸(VLCFA)的β-氧化过程。ABCD3蛋白以同源二聚体形式发挥作用,将底物转运进入过氧化物酶体。该基因突变可能导致过氧化物酶体功能障碍,与多种过氧化物酶体疾病相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
过氧化物酶体生物发生障碍 ABCD3突变导致过氧化物酶体功能异常,影响VLCFA代谢,可能引起神经系统发育异常等。 ClinVar, OMIM
肾上腺脑白质营养不良 部分ABCD3变异与肾上腺脑白质营养不良相关,但证据有限。 ClinVar
癌症 ABCD3在多种肿瘤中表达异常,可能参与肿瘤代谢重编程,但直接致病证据不足。 COSMIC

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
肝脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
肾脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HepG2 暂无可靠数据 肝癌细胞系
HEK293 暂无可靠数据 人胚肾细胞系
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1992C>T (p.Arg664Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function,导致蛋白截短,功能丧失
c.1512_1513del (p.Glu505fs) 移码突变 罕见 Loss of Function,导致蛋白截短,功能丧失
c.875G>A (p.Arg292His) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能,但证据有限
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失突变,导致ABCD3蛋白表达减少或功能丧失,影响过氧化物酶体转运。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005524 ATP binding • GO:0016887 ATP hydrolysis activity
• GO:0005778 peroxisomal membrane • GO:0005319 lipid transporter activity
• GO:0033142 very long-chain fatty acid transport

相关通路

Peroxisomal lipid metabolism (Reactome: R-HSA-9033241)
Fatty acid metabolism (KEGG: map01212)

蛋白质功能简介

ABCD3蛋白(又称PMP69)是过氧化物酶体膜上的ATP结合盒转运蛋白,属于D亚家族。该蛋白以同源二聚体形式存在,利用ATP水解能量将极长链脂肪酸(VLCFA)及其衍生物转运进入过氧化物酶体进行β-氧化。ABCD3在肝脏、肾脏等代谢活跃组织中高表达,其功能缺陷与过氧化物酶体疾病相关。

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