ADNP基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
ADNP基因编码活性依赖性神经保护蛋白,对神经发育和突触功能至关重要,其突变与自闭症谱系障碍和ADNP综合征相关。
基因信息卡
| 基因符号 | ADNP |
|---|---|
| 基因全名 | activity dependent neuroprotector homeobox |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 20q13.13 |
| NCBI Gene ID | 7403 ncbi.nlm.nih.gov/gene/7403 |
| Ensembl ID | ENSG00000101126 |
| UniProt ID | Q9H2P0 |
| OMIM ID | 611386 |
| HGNC ID | 15779 |
| 基因别名 | ADNP1, KIAA0784 |
基因功能与研究简介
ADNP基因编码活性依赖性神经保护蛋白(ADNP),该蛋白是一种含有同源异型结构域的转录因子,在神经发育、突触可塑性和神经保护中发挥关键作用。ADNP通过调控多种靶基因的表达,参与神经元分化、轴突生长和突触形成。ADNP基因突变与神经发育障碍密切相关,尤其是ADNP综合征(Helsmoortel-Van der Aa综合征)和自闭症谱系障碍(ASD)。此外,ADNP在癌症中也具有潜在作用,但其具体机制仍在研究中。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| ADNP综合征 | ADNP基因的杂合致病性变异(主要为功能缺失突变)导致单倍剂量不足,影响神经发育相关基因的表达,导致智力障碍、自闭症、面部畸形等。 | 已明确致病(OMIM 615873) |
| 自闭症谱系障碍 | ADNP基因突变是ASD的常见单基因病因之一,通过影响突触功能和神经发育导致ASD。 | 已明确致病(多项研究,PMID: 24680889) |
| 智力障碍 | ADNP突变导致认知功能障碍,与ADNP综合征重叠。 | 已明确致病(OMIM 615873) |
| 癌症 | ADNP在多种肿瘤中表达异常,可能通过调控细胞增殖和凋亡参与肿瘤发生,但具体机制尚不明确。 | 潜在关联(研究证据有限) |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 高表达(根据UniProt和文献) |
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| SH-SY5Y | 暂无可靠数据 | 神经母细胞瘤细胞系,常用于ADNP功能研究 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系,用于基础研究 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 人胚胎肾细胞系,用于蛋白表达研究 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.2187dupC (p.Arg730ProfsTer3) | 移码突变 | 常见于ADNP综合征 | Loss of Function(功能缺失) |
| c.2212C>T (p.Arg738Ter) | 无义突变 | 常见于ADNP综合征 | Loss of Function(功能缺失) |
| c.1996C>T (p.Arg666Ter) | 无义突变 | 常见于ADNP综合征 | Loss of Function(功能缺失) |
| c.2157_2158del (p.Val720GlyfsTer2) | 移码突变 | 罕见 | Loss of Function(功能缺失) |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能缺失突变(Loss of Function)是ADNP相关疾病的主要机制,包括无义突变、移码突变等,导致蛋白截短或降解,引起单倍剂量不足。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明ADNP存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明ADNP突变具有显性负效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003677 (DNA binding) | • GO:0005515 (protein binding) |
| • GO:0005634 (nucleus) | • GO:0007399 (nervous system development) |
| • GO:0045202 (synapse) | • GO:0008134 (transcription factor binding) |
相关通路
• Neurotrophin signaling pathway (KEGG: hsa04722)
• Axon guidance (KEGG: hsa04360)
• Synaptic vesicle cycle (KEGG: hsa04721)
蛋白质功能简介
ADNP蛋白(UniProt Q9H2P0)由1102个氨基酸组成,包含一个同源异型结构域(homeobox domain)和多个锌指结构域。ADNP作为转录因子,调控与神经发育相关的基因表达,如EBF1、FOXP1等。ADNP还参与染色质重塑和DNA损伤修复。在细胞中,ADNP定位于细胞核,并在神经元中高表达。ADNP蛋白的缺失或突变导致神经发育异常,与ADNP综合征和自闭症相关。
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