AFF1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

AFF1基因编码AF4/FMR2家族转录调控因子,参与基因表达调控和细胞周期,其异常与急性淋巴细胞白血病等疾病相关。

基因信息卡

基因符号 AFF1
基因全名 AF4/FMR2 family member 1
基因类型 protein-coding
染色体位置 4q21.3
NCBI Gene ID 4299 ncbi.nlm.nih.gov/gene/4299
Ensembl ID ENSG00000172493
UniProt ID P51825
OMIM ID 159557
HGNC ID 7135
基因别名 AF4, MLLT2, PBM1

基因功能与研究简介

AFF1基因编码AF4/FMR2家族成员1,是一种转录调控因子,参与RNA聚合酶II介导的转录延伸和基因表达调控。AFF1蛋白与多种蛋白复合物相互作用,包括超级延伸复合物(SEC),在细胞增殖、分化和凋亡中发挥重要作用。AFF1基因的异常(如染色体易位导致融合蛋白)与急性淋巴细胞白血病(ALL)等恶性肿瘤密切相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
急性淋巴细胞白血病 AFF1基因与MLL基因发生易位形成MLL-AFF1融合蛋白,导致基因表达失调,促进白血病发生。 已明确致病
急性髓系白血病 AFF1基因易位也见于部分急性髓系白血病(AML)患者,机制类似。 具有较强研究证据
其他癌症 AFF1基因异常可能与其他实体瘤相关,但证据有限。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
骨髓 暂无可靠数据 高表达于造血组织
胸腺 暂无可靠数据 高表达于免疫组织
脾脏 暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
K562 暂无可靠数据 慢性粒细胞白血病细胞系
MOLT-4 暂无可靠数据 急性淋巴细胞白血病细胞系
HL-60 暂无可靠数据 急性髓系白血病细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
t(4;11)(q21;q23) 染色体易位 常见于婴儿ALL 形成MLL-AFF1融合蛋白,功能获得性突变,导致转录失调
点突变 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能,但具体影响需进一步研究
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

AFF1基因的功能缺失突变可能导致转录调控异常,影响细胞正常功能,但具体致病机制尚不明确。

Gain of Function(功能获得,GOF)

MLL-AFF1融合蛋白具有功能获得性,通过异常激活转录导致白血病发生。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明AFF1突变具有显性负效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 protein binding • GO:0005634 nucleus
• GO:0006351 transcription • DNA-templated
• GO:0006355 regulation of transcription • DNA-templated
• GO:0006366 transcription by RNA polymerase II • GO:0008270 zinc ion binding

相关通路

Super Elongation Complex (SEC) pathway
Transcriptional regulation by RNA polymerase II

蛋白质功能简介

AFF1蛋白是AF4/FMR2家族成员,含有多个功能域,包括N端同源域、核定位信号和转录激活域。AFF1蛋白与多种蛋白相互作用,如MLL、ELL和P-TEFb,参与超级延伸复合物的形成,调控RNA聚合酶II的转录延伸。AFF1在造血细胞中高表达,对正常造血和免疫发育至关重要。

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