AFF3基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

AFF3基因编码AF4/FMR2家族转录调控因子,参与淋巴细胞发育和免疫应答,其异常与自身免疫病及肿瘤相关。

基因信息卡

基因符号 AFF3
基因全名 AF4/FMR2 family member 3
基因类型 protein-coding
染色体位置 2q11.2
NCBI Gene ID 3899 ncbi.nlm.nih.gov/gene/3899
Ensembl ID ENSG00000144218
UniProt ID P51826
OMIM ID 601937
HGNC ID HGNC:325
基因别名 AF4, MLLT2-like, LAF4

基因功能与研究简介

AFF3基因编码AF4/FMR2家族成员3,是一种转录调控因子,参与RNA聚合酶II介导的转录延伸和染色质修饰。AFF3在淋巴细胞中高表达,对B细胞和T细胞的发育及功能至关重要。研究表明,AFF3的异常表达与自身免疫病(如类风湿关节炎)和某些癌症相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
类风湿关节炎 AFF3基因多态性影响免疫应答,增加疾病风险 较强研究证据
自身免疫病 AFF3参与调节性T细胞功能,异常表达可能导致免疫失调 潜在关联
急性淋巴细胞白血病 AFF3与MLL融合形成致癌蛋白,驱动白血病发生 已明确致病
乳腺癌 AFF3表达异常可能影响细胞增殖和凋亡,与肿瘤进展相关 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
淋巴结 暂无可靠数据 高表达
脾脏 暂无可靠数据 高表达
外周血 暂无可靠数据 中等表达
胸腺 暂无可靠数据 中等表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
B淋巴细胞 暂无可靠数据 高表达
T淋巴细胞 暂无可靠数据 高表达
Jurkat细胞 暂无可靠数据 高表达
Ramos细胞 暂无可靠数据 高表达
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
rs10865035 SNP 风险等位基因频率约0.3 影响AFF3表达,与类风湿关节炎风险相关
MLL-AFF3融合 染色体易位 罕见 产生致癌融合蛋白,导致急性淋巴细胞白血病
错义突变 点突变 罕见 可能影响蛋白功能,但具体影响需进一步研究
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

AFF3功能缺失可能导致淋巴细胞发育异常和免疫缺陷,但具体证据有限。

Gain of Function(功能获得,GOF)

MLL-AFF3融合蛋白具有异常转录激活活性,促进白血病发生,属于功能获得性突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明AFF3突变具有显性负效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 protein binding • GO:0005634 nucleus
• GO:0006351 transcription • DNA-templated
• GO:0006355 regulation of transcription • DNA-templated
• GO:0006366 transcription by RNA polymerase II • GO:0005654 nucleoplasm

相关通路

hsa05202 Transcriptional misregulation in cancer
hsa04662 B cell receptor signaling pathway
hsa04659 Th17 cell differentiation

蛋白质功能简介

AFF3蛋白属于AF4/FMR2家族,包含一个N端同源结构域和一个C端转录激活结构域。它作为转录延伸因子复合物的一部分,与RNA聚合酶II相互作用,调节基因表达。AFF3在淋巴细胞中高表达,参与免疫应答和细胞周期调控。其异常表达或融合与多种疾病相关。

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