AGAP3基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

AGAP3编码ADP核糖基化因子GTP酶激活蛋白,参与囊泡运输和神经信号传导,与神经系统疾病和癌症相关。

基因信息卡

基因符号 AGAP3
基因全名 ArfGAP with GTPase domain, ankyrin repeat and PH domain 3
基因类型 protein-coding
染色体位置 7q36.1
NCBI Gene ID 116988 ncbi.nlm.nih.gov/gene/116988
Ensembl ID ENSG00000133612
UniProt ID Q96P47
OMIM ID 609854
HGNC ID 16921
基因别名 AGAP-3, ArfGAP3, FLJ21918, MGC126619, MGC126621

基因功能与研究简介

AGAP3基因编码ADP核糖基化因子GTP酶激活蛋白(ArfGAP),属于AGAP家族。该蛋白包含GTP酶结构域、锚蛋白重复序列和PH结构域,参与调控ADP核糖基化因子(Arf)介导的囊泡运输和细胞骨架重塑。AGAP3在神经系统中高表达,可能参与突触囊泡循环和神经递质释放。研究表明AGAP3与某些神经系统疾病和癌症相关,但具体机制仍在研究中。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
精神分裂症 AGAP3基因变异可能影响突触功能,增加精神分裂症风险。 较强研究证据
自闭症谱系障碍 AGAP3基因拷贝数变异或突变可能影响神经发育,与自闭症相关。 潜在关联
癌症 AGAP3在多种肿瘤中表达异常,可能通过调控细胞增殖和迁移参与肿瘤发生。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
睾丸 暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经母细胞瘤细胞系
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
HEK293 暂无可靠数据 人胚胎肾细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
rs61740334 SNV 0.1% 可能影响蛋白功能,与精神分裂症相关
c.1543A>G (p.Ile515Val) 错义突变 罕见 可能影响GTP酶活性
拷贝数变异 CNV 罕见 可能影响基因表达剂量
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失型突变可能导致AGAP3蛋白活性降低,影响囊泡运输和神经信号传导。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变可能增强AGAP3活性,导致细胞信号异常。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变可能干扰正常AGAP3功能,影响蛋白复合物形成。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005096 (GTPase activator activity) • GO:0005515 (protein binding)
• GO:0005737 (cytoplasm) • GO:0005794 (Golgi apparatus)
• GO:0006886 (intracellular protein transport) • GO:0030036 (actin cytoskeleton organization)

相关通路

Arf6 signaling pathway
Vesicle-mediated transport

蛋白质功能简介

AGAP3蛋白属于ArfGAP家族,包含GTP酶结构域、锚蛋白重复序列和PH结构域。该蛋白通过激活Arf GTP酶活性,调控囊泡运输和细胞骨架重塑。在神经系统中,AGAP3参与突触囊泡循环和神经递质释放。其功能异常可能与神经系统疾病和癌症相关。

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