AHDC1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
AHDC1基因编码AT钩DNA结合基序蛋白,参与基因转录调控,其突变与发育迟缓、智力障碍等疾病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | AHDC1 |
|---|---|
| 基因全名 | AT-hook DNA binding motif containing 1 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 1p36.11 |
| NCBI Gene ID | 27245 ncbi.nlm.nih.gov/gene/27245 |
| Ensembl ID | ENSG00000116285 |
| UniProt ID | Q5T7M9 |
| OMIM ID | 615790 |
| HGNC ID | 25230 |
| 基因别名 | AT-hook DNA-binding motif-containing protein 1; dJ1158H2.1 |
基因功能与研究简介
AHDC1基因编码AT钩DNA结合基序蛋白1,该蛋白含有AT钩结构域,能够结合DNA的AT富集区域,参与基因转录调控和染色质重塑。AHDC1在多种组织中表达,尤其在脑组织中高表达,提示其在神经系统发育中具有重要作用。AHDC1基因突变与发育迟缓、智力障碍、肌张力低下等疾病相关,其突变类型包括错义突变、无义突变和移码突变等。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 发育迟缓 | AHDC1基因突变导致蛋白功能异常,影响神经发育,导致发育迟缓。 | ClinVar, OMIM |
| 智力障碍 | AHDC1基因突变与智力障碍相关,可能通过影响基因表达调控和突触可塑性。 | ClinVar, OMIM |
| 肌张力低下 | AHDC1基因突变可导致肌张力低下,可能与神经肌肉发育异常有关。 | ClinVar |
| 自闭症谱系障碍 | 部分AHDC1基因突变与自闭症谱系障碍相关,但证据尚不充分。 | ClinVar |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
| 肝 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| SH-SY5Y | 暂无可靠数据 | 神经母细胞瘤细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1465C>T (p.Arg489Ter) | 无义突变 | 罕见 | 导致蛋白截短,功能丧失 |
| c.1882C>T (p.Arg628Trp) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能 |
| c.2083dup (p.Gln695ProfsTer23) | 移码突变 | 罕见 | 导致蛋白截短,功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
无义突变、移码突变等导致蛋白截短或降解,功能丧失。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003677 DNA binding | • GO:0005634 nucleus |
| • GO:0006355 regulation of transcription | • DNA-templated |
蛋白质功能简介
AHDC1蛋白含有AT钩结构域,能够结合DNA的AT富集区域,参与基因转录调控和染色质重塑。该蛋白在脑组织中高表达,提示其在神经发育中具有重要作用。AHDC1蛋白可能与其他转录因子或染色质重塑复合物相互作用,调控靶基因的表达。