ALDH1A2基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
ALDH1A2编码视黄醛脱氢酶2,是维甲酸合成关键酶,参与胚胎发育、细胞分化及多种疾病。
基因信息卡
| 基因符号 | ALDH1A2 |
|---|---|
| 基因全名 | Aldehyde Dehydrogenase 1 Family Member A2 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 15q21.3 |
| NCBI Gene ID | 8854 ncbi.nlm.nih.gov/gene/8854 |
| Ensembl ID | ENSG00000128918 |
| UniProt ID | O94788 |
| OMIM ID | 603687 |
| HGNC ID | 407 |
| 基因别名 | RALDH2, RALDH(II), RALDH-2 |
基因功能与研究简介
ALDH1A2基因编码醛脱氢酶1家族成员A2,属于醛脱氢酶家族。该酶以NAD+为辅因子,催化视黄醛(retinaldehyde)氧化为维甲酸(retinoic acid),是维甲酸合成途径的关键酶。维甲酸在胚胎发育、细胞增殖、分化和凋亡中发挥重要调控作用。ALDH1A2在多种组织中表达,尤其在胚胎发育早期和成体某些组织中高表达。该基因突变或表达异常与多种疾病相关,包括先天性心脏病、神经管缺陷、DiGeorge综合征等,并在多种癌症中表达异常。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 先天性心脏病 | ALDH1A2突变导致维甲酸合成不足,影响心脏发育,与先天性心脏病相关。 | 已明确致病 |
| 神经管缺陷 | ALDH1A2突变影响维甲酸信号,导致神经管闭合异常,与神经管缺陷相关。 | 已明确致病 |
| DiGeorge综合征 | ALDH1A2表达异常与DiGeorge综合征的颅面畸形和心脏缺陷相关。 | 具有较强研究证据 |
| 癌症 | ALDH1A2在多种癌症中表达下调或启动子甲基化,可能通过影响维甲酸信号促进肿瘤发生。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 小肠 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1105C>T (p.Arg369*) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function,导致蛋白质截短,酶活性丧失 |
| c.841G>A (p.Gly281Ser) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响酶活性,功能影响待验证 |
| c.1336G>A (p.Gly446Arg) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响酶活性,功能影响待验证 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
Loss of Function(功能缺失):突变导致酶活性降低或丧失,如无义突变、移码突变等。
Gain of Function(功能获得,GOF)
Gain of Function(功能获得):目前暂无明确证据表明ALDH1A2存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
Dominant Negative(显性负性):目前暂无明确证据表明ALDH1A2存在显性负性突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0004029 (aldehyde dehydrogenase (NAD+) activity) | • GO:0001758 (retinal dehydrogenase activity) |
| • GO:0005829 (cytosol) | • GO:0005737 (cytoplasm) |
| • GO:0005634 (nucleus) | • GO:0001525 (angiogenesis) |
| • GO:0009952 (anterior/posterior pattern specification) | • GO:0009887 (animal organ morphogenesis) |
| • GO:0007275 (multicellular organism development) | • GO:0045944 (positive regulation of transcription by RNA polymerase II) |
相关通路
• Retinol metabolism (KEGG: hsa00830)
• Retinoic acid biosynthesis (Reactome: R-HSA-5365859)
• Metabolism of vitamins and cofactors (Reactome: R-HSA-196854)
蛋白质功能简介
ALDH1A2蛋白(UniProt O94788)属于醛脱氢酶家族,定位于细胞质。该蛋白以NAD+为辅因子,催化视黄醛氧化为维甲酸,是维甲酸生物合成的关键酶。维甲酸是维生素A的活性代谢产物,通过核受体(RAR/RXR)调控基因表达,影响细胞增殖、分化和凋亡。ALDH1A2在胚胎发育中尤为重要,参与前后轴模式形成、器官发生等过程。