ALLC基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

ALLC基因编码尿刊酸酶,参与组氨酸代谢,其缺陷与尿刊酸尿症相关。

基因信息卡

基因符号 ALLC
基因全名 allantoicase
基因类型 protein-coding
染色体位置 2p25.3
NCBI Gene ID 55821 ncbi.nlm.nih.gov/gene/55821
Ensembl ID ENSG00000005059
UniProt ID Q8N6M0
OMIM ID 611672
HGNC ID 24478
基因别名 allantoicase; allantoinase

基因功能与研究简介

ALLC基因编码尿刊酸酶(allantoicase),该酶在组氨酸代谢途径中催化尿刊酸(urocanic acid)水解为4-咪唑酮-5-丙酸(4-imidazolone-5-propionic acid)。ALLC基因突变可导致尿刊酸尿症(urocanic aciduria),这是一种罕见的常染色体隐性遗传病,患者尿液中尿刊酸水平升高,可能伴有神经系统症状。目前,ALLC基因在癌症中的研究证据有限,暂无明确证据表明其直接参与肿瘤发生。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
尿刊酸尿症 ALLC基因突变导致尿刊酸酶活性降低或缺失,使尿刊酸无法正常代谢,在体内蓄积并从尿液中排出。 已明确致病
暂无其他明确疾病关联 暂无可靠数据 暂无明确证据

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
肝脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
肾脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HepG2 暂无可靠数据 肝癌细胞系
HEK293 暂无可靠数据 人胚胎肾细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234C>T (p.Arg412Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function,导致蛋白质截短,酶活性丧失
c.567_568del (p.Leu190fs) 移码突变 罕见 Loss of Function,导致蛋白质截短,酶活性丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

Loss of Function(功能缺失型突变):导致尿刊酸酶活性降低或完全丧失,是尿刊酸尿症的主要致病机制。

Gain of Function(功能获得,GOF)

Gain of Function(功能获得型突变):目前暂无明确证据表明ALLC基因存在功能获得型突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

Dominant Negative(显性负性突变):目前暂无明确证据表明ALLC基因存在显性负性突变。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0004035 (allantoicase activity) • GO:0006548 (histidine catabolic process)
• GO:0005829 (cytosol)

相关通路

Histidine metabolism (hsa00340)

蛋白质功能简介

ALLC基因编码的尿刊酸酶(allantoicase)是一种参与组氨酸代谢的酶,催化尿刊酸水解为4-咪唑酮-5-丙酸。该酶主要在肝脏和肾脏中表达,但具体表达水平暂无可靠数据。ALLC基因突变导致酶活性缺失,引起尿刊酸尿症。目前,关于ALLC蛋白的结构和功能研究较少,但已知其属于金属依赖性水解酶家族。

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