ALMS1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
ALMS1基因编码中心体蛋白,其突变导致Alström综合征,并与肥胖、胰岛素抵抗等代谢异常相关。
基因信息卡
| 基因符号 | ALMS1 |
|---|---|
| 基因全名 | ALMS1 centrosome and basal body associated protein |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 2p13.1 |
| NCBI Gene ID | 7840 ncbi.nlm.nih.gov/gene/7840 |
| Ensembl ID | ENSG00000116141 |
| UniProt ID | Q8TCU4 |
| OMIM ID | 606844 |
| HGNC ID | 428 |
| 基因别名 | ALSS, KIAA0328 |
基因功能与研究简介
ALMS1基因编码一种中心体蛋白,定位于中心体和基体,参与纤毛形成和功能维持。该基因突变导致Alström综合征(ALMS),一种罕见的常染色体隐性遗传病,表现为多器官系统异常,包括视网膜营养不良、感音神经性耳聋、肥胖、胰岛素抵抗和扩张型心肌病等。ALMS1蛋白在纤毛信号传导和细胞极性中发挥重要作用。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| Alström综合征 | ALMS1基因突变导致蛋白功能丧失,影响纤毛形成和信号传导,导致多系统发育异常。 | 已明确致病 |
| 肥胖 | ALMS1突变与肥胖相关,可能通过影响下丘脑瘦素信号通路和纤毛功能导致食欲调节异常。 | 具有较强研究证据 |
| 胰岛素抵抗 | ALMS1突变导致胰岛素信号通路异常,与2型糖尿病风险增加相关。 | 具有较强研究证据 |
| 扩张型心肌病 | ALMS1突变可导致心肌细胞功能异常,引起扩张型心肌病。 | 具有较强研究证据 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 脂肪组织 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 视网膜 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1048C>T (p.Arg350Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.11449C>T (p.Arg3817Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.1165_1166del (p.Ser389ValfsTer2) | 移码突变 | 罕见 | Loss of Function |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
ALMS1基因突变导致蛋白功能丧失,是Alström综合征的主要致病机制。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明ALMS1存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明ALMS1突变具有显性负效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005813 (centrosome) | • GO:0036064 (ciliary basal body) |
| • GO:0005515 (protein binding) | • GO:0005814 (centriole) |
相关通路
• 暂无明确通路数据
蛋白质功能简介
ALMS1蛋白是一种中心体蛋白,定位于中心体和基体,参与纤毛形成和功能维持。该蛋白包含多个卷曲螺旋结构域,可能参与蛋白-蛋白相互作用。ALMS1在纤毛信号传导、细胞极性和细胞周期调控中发挥作用。