AMFR基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

AMFR(Autocrine Motility Factor Receptor)是一种E3泛素连接酶,参与蛋白质降解、细胞运动及肿瘤进展,是癌症研究的重要靶点。

基因信息卡

基因符号 AMFR
基因全名 Autocrine Motility Factor Receptor
基因类型 protein-coding
染色体位置 16q21
NCBI Gene ID 267 ncbi.nlm.nih.gov/gene/267
Ensembl ID ENSG00000159461
UniProt ID Q9UKV5
OMIM ID 603243
HGNC ID 463
基因别名 RNF45, gp78

基因功能与研究简介

AMFR(Autocrine Motility Factor Receptor)基因编码一种E3泛素连接酶,属于RING finger蛋白家族。该蛋白定位于内质网,参与内质网相关蛋白降解(ERAD)途径,通过泛素化底物调控蛋白质稳态。AMFR还参与细胞运动、肿瘤侵袭和转移,其表达水平与多种癌症的预后相关。此外,AMFR在神经退行性疾病中可能发挥作用。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
肝细胞癌 AMFR高表达与肿瘤侵袭和转移相关,可能通过促进细胞运动和上皮-间质转化(EMT)参与肝癌进展。 较强研究证据
乳腺癌 AMFR在乳腺癌中高表达,与不良预后相关,可能通过调控细胞运动促进转移。 较强研究证据
前列腺癌 AMFR表达上调与前列腺癌的进展和转移相关。 研究证据有限
神经退行性疾病 AMFR参与错误折叠蛋白的降解,可能影响神经退行性疾病(如阿尔茨海默病)的病理过程。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
肝脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
乳腺 暂无可靠数据 暂无可靠数据
前列腺 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HepG2 暂无可靠数据 肝癌细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
PC3 暂无可靠数据 前列腺癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234A>G (p.Lys412Glu) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能,但具体影响未知
c.567C>T (p.Arg189Trp) 错义突变 罕见 可能影响蛋白稳定性或活性
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

Loss of Function(功能缺失):可能导致AMFR的E3泛素连接酶活性降低,影响ERAD途径,导致错误蛋白积累。

Gain of Function(功能获得,GOF)

Gain of Function(功能获得):可能增强AMFR的活性,促进细胞运动和肿瘤转移。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

Dominant Negative(显性负性):突变蛋白可能干扰野生型AMFR的功能,导致泛素化异常。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0004842 - ubiquitin-protein transferase activity • GO:0005515 - protein binding
• GO:0005783 - endoplasmic reticulum • GO:0006511 - ubiquitin-dependent protein catabolic process
• GO:0006928 - movement of cell or subcellular component

相关通路

Endoplasmic reticulum-associated degradation (ERAD) pathway
Ubiquitin-proteasome pathway

蛋白质功能简介

AMFR蛋白(UniProt Q9UKV5)是一种内质网跨膜蛋白,包含RING finger结构域和CUE结构域,具有E3泛素连接酶活性。它参与内质网相关蛋白降解(ERAD),通过泛素化错误折叠蛋白并引导其降解。AMFR还参与细胞运动调控,与肿瘤侵袭和转移相关。

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