AMMECR1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
AMMECR1基因编码一种参与核功能调控的蛋白,其突变与AMMECR1相关综合征及多种发育异常相关。
基因信息卡
| 基因符号 | AMMECR1 |
|---|---|
| 基因全名 | Alport syndrome, mental retardation, midface hypoplasia and elliptocytosis chromosomal region gene 1 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | Xq23 |
| NCBI Gene ID | 440491 ncbi.nlm.nih.gov/gene/440491 |
| Ensembl ID | ENSG00000101974 |
| UniProt ID | Q9Y4X0 |
| OMIM ID | 300195 |
| HGNC ID | 24072 |
| 基因别名 | AMMECR1, AMMECR1A |
基因功能与研究简介
AMMECR1基因位于X染色体q23区域,编码一个含有核定位信号的蛋白质,参与多种细胞过程,包括转录调控、DNA损伤修复和细胞周期调控。该基因突变与AMMECR1相关综合征(AMMECR1-related syndrome)相关,该综合征表现为智力障碍、中面部发育不全、椭圆红细胞增多症和Alport样肾病等。目前研究提示AMMECR1在核内发挥功能,可能通过与其他蛋白相互作用参与基因表达调控。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| AMMECR1相关综合征 | 致病机制:AMMECR1基因突变导致蛋白功能缺失或异常,影响核内调控过程,导致多系统发育异常。 | 已明确致病(OMIM) |
| Alport综合征 | 潜在关联:AMMECR1基因位于Alport综合征基因COL4A5附近,但AMMECR1突变本身不直接导致Alport综合征,可能为相邻基因缺失综合征的一部分。 | 潜在关联(OMIM) |
| 智力障碍 | 已明确致病:AMMECR1相关综合征的核心表型之一。 | 已明确致病(OMIM) |
| 中面部发育不全 | 已明确致病:AMMECR1相关综合征的核心表型之一。 | 已明确致病(OMIM) |
| 椭圆红细胞增多症 | 已明确致病:AMMECR1相关综合征的核心表型之一。 | 已明确致病(OMIM) |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1A>G (p.Met1Val) | 错义突变 | 暂无可靠数据 | 可能影响蛋白翻译起始,导致功能缺失 |
| c.2T>C (p.Met1Thr) | 错义突变 | 暂无可靠数据 | 可能影响蛋白翻译起始,导致功能缺失 |
| c.3G>A (p.Met1Ile) | 错义突变 | 暂无可靠数据 | 可能影响蛋白翻译起始,导致功能缺失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
Loss of Function(功能缺失):AMMECR1基因突变导致蛋白功能丧失或减少,是疾病的主要机制。
Gain of Function(功能获得,GOF)
Gain of Function(功能获得):目前暂无明确证据表明AMMECR1突变具有功能获得效应。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
Dominant Negative(显性负性效应):目前暂无明确证据表明AMMECR1突变具有显性负性效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005634 (nucleus) | • GO:0003677 (DNA binding) |
| • GO:0005515 (protein binding) |
相关通路
• 暂无明确通路数据
蛋白质功能简介
AMMECR1蛋白定位于细胞核,含有核定位信号,可能参与转录调控和DNA损伤修复。其具体功能尚在研究中,但已知其突变导致多系统发育异常。
相关产品
| 产品名称 | 货号 | 物种 | 基因 ID | |
|---|---|---|---|---|
| AMMECR1L基因敲除HEK293细胞 | EDJ-KQ9870 | 人 | 83607 | 详情 立即询价 |
| AMMECR1基因敲除HEK293细胞 | EDJ-KQ6187 | 人 | 9949 | 详情 立即询价 |
| AMMECR1基因敲除HCT116细胞 | EDJ-KQ31383 | 人 | 9949 | 详情 立即询价 |
| AMMECR1L基因敲除HCT116细胞 | EDJ-KQ36744 | 人 | 83607 | 详情 立即询价 |
| AMMECR1基因敲除A549细胞 | EDJ-KQ31382 | 人 | 9949 | 详情 立即询价 |
| AMMECR1L基因敲除A549细胞 | EDJ-KQ36743 | 人 | 83607 | 详情 立即询价 |
| AMMECR1基因敲除Hela细胞 | EDJ-KQ31384 | 人 | 9949 | 详情 立即询价 |
| AMMECR1L基因敲除Hela细胞 | EDJ-KQ36745 | 人 | 83607 | 详情 立即询价 |
Displaying Records 1 To 8 Of 8 Records