AP3D1基因|功能、疾病关联、突变与细胞模型研究
AP3D1编码衔接蛋白复合物3的δ亚基,参与溶酶体相关细胞器运输,其突变与Hermansky-Pudlak综合征相关。
基因信息卡
| 基因符号 | AP3D1 |
|---|---|
| 基因全名 | adaptor related protein complex 3 subunit delta 1 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 19p13.3 |
| NCBI Gene ID | 8943 ncbi.nlm.nih.gov/gene/8943 |
| Ensembl ID | ENSG00000065060 |
| UniProt ID | O14617 |
| OMIM ID | 607246 |
| HGNC ID | 568 |
| 基因别名 | ADTD; HPS10 |
基因功能与研究简介
AP3D1基因编码衔接蛋白复合物3(AP-3)的δ亚基。AP-3复合物是网格蛋白相关衔接蛋白家族成员,参与从反式高尔基网络或内体到溶酶体相关细胞器(如黑素体、血小板致密颗粒)的蛋白质分选和运输。AP3D1突变可导致Hermansky-Pudlak综合征10型(HPS10),表现为眼皮肤白化病、血小板储存池缺陷和免疫缺陷。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| Hermansky-Pudlak综合征10型 | AP3D1基因突变导致AP-3复合物功能异常,影响溶酶体相关细胞器的生物发生和运输,导致黑素体、血小板致密颗粒等形成障碍。 | 已明确致病 |
| 免疫缺陷 | AP3D1突变导致细胞毒性T淋巴细胞脱颗粒受损,引起免疫缺陷。 | 具有较强研究证据 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 全血 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 脾脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 淋巴结 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| Jurkat | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.3052C>T (p.Arg1018*) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.2086C>T (p.Arg696*) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.2923C>T (p.Arg975*) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
AP3D1突变导致蛋白功能丧失,影响AP-3复合物组装或稳定性,导致运输障碍。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0006886 (intracellular protein transport) | • GO:0030123 (AP-3 adaptor complex) |
| • GO:0005794 (Golgi apparatus) | • GO:0005768 (endosome) |
相关通路
• hsa04142 (Lysosome)
• hsa04650 (Natural killer cell mediated cytotoxicity)
蛋白质功能简介
AP3D1蛋白是AP-3复合物的δ亚基,分子量约160 kDa。该复合物介导跨膜蛋白从内体/高尔基体到溶酶体相关细胞器的分选。AP3D1包含一个N端结构域和多个WD40重复序列,参与蛋白相互作用。