APBA1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

APBA1编码神经元接头蛋白,参与突触囊泡运输和信号转导,与阿尔茨海默病等神经退行性疾病相关。

基因信息卡

基因符号 APBA1
基因全名 amyloid beta precursor protein binding family A member 1
基因类型 protein-coding
染色体位置 9q21.33
NCBI Gene ID 320 ncbi.nlm.nih.gov/gene/320
Ensembl ID ENSG00000107282
UniProt ID Q02410
OMIM ID 602414
HGNC ID 577
基因别名 ['D9S411E', 'MINT1', 'X11alpha', 'X11α']

基因功能与研究简介

APBA1(amyloid beta precursor protein binding family A member 1)编码一种神经元接头蛋白,属于X11样蛋白家族。该蛋白包含一个磷酸酪氨酸结合(PTB)结构域和两个PDZ结构域,能够与淀粉样前体蛋白(APP)的胞内域结合,参与突触囊泡运输、信号转导和蛋白质运输。APBA1在神经系统中高表达,与阿尔茨海默病(AD)的病理过程相关,可能影响APP的加工和Aβ的产生。此外,APBA1还参与突触可塑性和学习记忆过程。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
阿尔茨海默病 APBA1与APP相互作用,可能调节APP的加工和Aβ的产生,参与AD的病理过程。 较强研究证据
精神分裂症 APBA1基因变异与精神分裂症风险相关,可能影响突触功能。 潜在关联
自闭症谱系障碍 APBA1在突触功能中的作用可能涉及自闭症发病机制。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
睾丸 暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经母细胞瘤细胞系
SK-N-SH 暂无可靠数据 神经母细胞瘤细胞系
U87 暂无可靠数据 胶质母细胞瘤细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
rs2072374 SNV 未知 可能影响剪接或表达
rs10498633 SNV 未知 与精神分裂症相关
rs3746319 SNV 未知 可能影响蛋白功能
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失型突变可能导致APBA1蛋白表达减少或功能丧失,影响突触囊泡运输和APP加工,可能增加神经退行性疾病风险。

Gain of Function(功能获得,GOF)

目前暂无明确证据表明APBA1存在功能获得型突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

目前暂无明确证据表明APBA1存在显性负性突变。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 protein binding • GO:0005737 cytoplasm
• GO:0005886 plasma membrane • GO:0008021 synaptic vesicle
• GO:0030054 cell junction • GO:0045202 synapse
• GO:0006886 intracellular protein transport • GO:0007268 chemical synaptic transmission
• GO:0007612 learning • GO:0007613 memory

相关通路

Alzheimer's disease pathway (KEGG: hsa05010)
Synaptic vesicle cycle (KEGG: hsa04721)
Neurotrophin signaling pathway (KEGG: hsa04722)

蛋白质功能简介

APBA1蛋白(UniProt Q02410)由837个氨基酸组成,分子量约92 kDa。该蛋白包含一个N端的PTB结构域和两个C端的PDZ结构域。PTB结构域介导与APP的胞内域结合,PDZ结构域参与蛋白-蛋白相互作用,可能与其他突触蛋白结合。APBA1主要定位于细胞质和突触囊泡,参与突触囊泡的运输和融合过程。此外,APBA1可能通过调节APP的加工影响Aβ的产生,从而参与阿尔茨海默病的发病机制。

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