APBB1IP基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

APBB1IP编码Rap1 GTP酶效应蛋白,调控整合素信号和细胞黏附,与免疫缺陷和自身免疫疾病相关。

基因信息卡

基因符号 APBB1IP
基因全名 amyloid beta precursor protein binding family B member 1 interacting protein
基因类型 protein-coding
染色体位置 10p12.1
NCBI Gene ID 54518 ncbi.nlm.nih.gov/gene/54518
Ensembl ID ENSG00000120063
UniProt ID Q7Z5R6
OMIM ID 609036
HGNC ID 24057
基因别名 RAPL, PREL-1, RAPL1, RAPL2

基因功能与研究简介

APBB1IP(amyloid beta precursor protein binding family B member 1 interacting protein)编码一种Rap1 GTP酶效应蛋白,参与整合素介导的细胞黏附、迁移和免疫突触形成。该蛋白在淋巴细胞和巨噬细胞中高表达,通过调节Rap1活性影响细胞极化和趋化。APBB1IP功能缺失与免疫缺陷和自身免疫疾病相关,其突变可能导致免疫系统功能异常。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
免疫缺陷 APBB1IP突变导致Rap1信号受损,影响淋巴细胞黏附和迁移,导致免疫功能缺陷。 ClinVar
自身免疫疾病 APBB1IP功能异常可能促进自身免疫反应,但具体机制尚在研究中。 OMIM
癌症 APBB1IP在多种肿瘤中表达异常,可能影响肿瘤细胞侵袭和转移,但证据尚不充分。 COSMIC

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
脾脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
淋巴结 暂无可靠数据 暂无可靠数据
外周血 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
Jurkat 暂无可靠数据 T细胞系
THP-1 暂无可靠数据 单核细胞系
Raji 暂无可靠数据 B细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234C>T (p.Arg412Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.567_568del (p.Glu190fs) 移码突变 罕见 Loss of Function
c.890A>G (p.Tyr297Cys) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失突变,导致蛋白截短或降解,影响Rap1信号通路。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 (protein binding) • GO:0007264 (small GTPase mediated signal transduction)
• GO:0007155 (cell adhesion) • GO:0030036 (actin cytoskeleton organization)
• GO:0005886 (plasma membrane)

相关通路

Rap1 signaling pathway (WP330)
Integrin signaling pathway (WP24)

蛋白质功能简介

APBB1IP蛋白包含一个Rap1结合域和一个pleckstrin同源(PH)域,通过结合Rap1-GTP调控下游效应分子,如RAP1GAP和TIAM1,从而影响细胞黏附、迁移和极性。在免疫细胞中,APBB1IP参与免疫突触的形成和T细胞活化。

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