APOBEC3G基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

APOBEC3G是一种胞苷脱氨酶,通过编辑病毒和逆转录转座子基因组发挥抗病毒作用,并与癌症突变相关。

基因信息卡

基因符号 APOBEC3G
基因全名 apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3G
基因类型 protein-coding
染色体位置 22q13.1
NCBI Gene ID 60489 ncbi.nlm.nih.gov/gene/60489
Ensembl ID ENSG00000139767
UniProt ID Q9HC16
OMIM ID 607113
HGNC ID 17357
基因别名 A3G, bK150C2.7, MDS019, dJ494G10.1

基因功能与研究简介

APOBEC3G(载脂蛋白B mRNA编辑酶催化多肽3G)属于APOBEC3家族,是一种胞苷脱氨酶,能够将单链DNA中的胞嘧啶脱氨基为尿嘧啶,从而在病毒复制过程中引入致死性突变。APOBEC3G在先天免疫中发挥关键作用,尤其对HIV-1等逆转录病毒具有强效抑制作用。此外,APOBEC3G的异常表达或突变可能导致基因组不稳定,与多种癌症的发生发展相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
HIV-1感染 APOBEC3G通过脱氨作用抑制HIV-1复制,但HIV-1的Vif蛋白可诱导其降解,导致病毒逃逸。 已明确致病机制
癌症(多种类型) APOBEC3G的异常表达或突变可能诱导基因组突变,与乳腺癌、肺癌、膀胱癌等癌症相关。 具有较强研究证据
自身免疫性疾病 APOBEC3G可能参与自身免疫反应,但具体机制尚不明确。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
脾脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
淋巴结 暂无可靠数据 暂无可靠数据
外周血 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
T细胞系(如Jurkat) 暂无可靠数据 暂无可靠数据
单核细胞系(如THP-1) 暂无可靠数据 暂无可靠数据
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
H186R 错义突变 罕见 可能影响脱氨酶活性
R320Q 错义突变 罕见 可能影响底物识别
D316N 错义突变 罕见 可能影响催化活性
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

Loss of Function(功能缺失型):突变导致APOBEC3G脱氨酶活性降低或丧失,削弱其抗病毒能力。

Gain of Function(功能获得,GOF)

Gain of Function(功能获得型):突变增强APOBEC3G的脱氨酶活性,可能导致基因组突变增加。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

Dominant Negative(显性负性):突变蛋白干扰野生型APOBEC3G的功能,导致整体活性下降。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003824 (catalytic activity) • GO:0008270 (zinc ion binding)
• GO:0005634 (nucleus) • GO:0005737 (cytoplasm)
• GO:0005654 (nucleoplasm) • GO:0008270 (zinc ion binding)
• GO:0008270 (zinc ion binding)

相关通路

hsa05164 (Influenza A)
hsa05162 (Measles)
hsa05161 (Hepatitis B)
hsa05160 (Hepatitis C)
hsa05166 (HTLV-I infection)
hsa05167 (Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus infection)
hsa05168 (Herpes simplex virus 1 infection)
hsa05169 (Epstein-Barr virus infection)
hsa05170 (Human immunodeficiency virus 1 infection)

蛋白质功能简介

APOBEC3G蛋白由384个氨基酸组成,包含一个胞苷脱氨酶结构域和一个假催化结构域。它主要定位于细胞质,在mRNA加工体中发挥作用。APOBEC3G通过脱氨基作用编辑单链DNA,抑制逆转录病毒和逆转录转座子的复制。此外,APOBEC3G还参与细胞内的DNA损伤反应和免疫调节。

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