APOD基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

APOD基因编码载脂蛋白D,参与脂质运输、神经保护和应激反应,与多种神经系统疾病和癌症相关。

基因信息卡

基因符号 APOD
基因全名 apolipoprotein D
基因类型 protein-coding
染色体位置 3q29
NCBI Gene ID 347 ncbi.nlm.nih.gov/gene/347
Ensembl ID ENSG00000189058
UniProt ID P05090
OMIM ID 107740
HGNC ID 604
基因别名 ApoD

基因功能与研究简介

APOD基因编码载脂蛋白D(ApoD),是一种糖基化脂质结合蛋白,属于脂质运载蛋白家族。ApoD在多种组织中表达,尤其在神经系统和脂肪组织中高表达。它参与脂质运输、神经保护、抗氧化应激和炎症调节等过程。APOD基因的变异与多种疾病相关,包括神经系统疾病和某些癌症。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
阿尔茨海默病 APOD表达水平在阿尔茨海默病患者脑组织中显著升高,可能参与淀粉样蛋白沉积和神经炎症反应,但具体机制尚不完全明确。 较强研究证据
帕金森病 APOD在帕金森病患者黑质中表达上调,可能通过抗氧化和神经营养作用发挥保护效应。 较强研究证据
精神分裂症 APOD基因多态性与精神分裂症风险相关,可能影响脂质代谢和神经发育。 潜在关联
乳腺癌 APOD在乳腺癌组织中表达异常,可能通过调节脂质代谢影响肿瘤进展。 潜在关联
前列腺癌 APOD表达与前列腺癌的进展和预后相关,可能作为肿瘤抑制因子。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
脂肪组织 暂无可靠数据 高表达
肾上腺 暂无可靠数据 中等表达
心脏 暂无可靠数据 低表达
肝脏 暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
U87 暂无可靠数据 胶质母细胞瘤细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
PC3 暂无可靠数据 前列腺癌细胞系
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经母细胞瘤细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
rs5952 SNP 常见 位于3'UTR,可能影响miRNA结合,与精神分裂症风险相关
rs1568566 SNP 常见 位于内含子,可能影响剪接,与阿尔茨海默病相关
rs2070951 SNP 常见 错义突变(p.Thr158Met),可能影响蛋白稳定性,与帕金森病相关
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

暂无明确证据表明APOD存在致病性功能缺失突变。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明APOD存在致病性功能获得突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明APOD存在显性负性突变。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005319 (lipid transporter activity) • GO:0008289 (lipid binding)
• GO:0005615 (extracellular space) • GO:0005886 (plasma membrane)
• GO:0006954 (inflammatory response) • GO:0006979 (response to oxidative stress)

相关通路

REACT_147653 (Transport of small molecules)
REACT_147659 (Lipoprotein metabolism)

蛋白质功能简介

载脂蛋白D(ApoD)是一种29 kDa的糖蛋白,属于脂质运载蛋白家族。它包含一个脂质结合口袋,能够结合多种疏水性配体,如胆固醇、花生四烯酸和类固醇激素。ApoD在神经系统中高表达,具有神经营养和抗氧化功能,能够保护神经元免受氧化应激和炎症损伤。此外,ApoD还参与脂质运输和代谢调节,在脂肪组织和外周组织中发挥重要作用。

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