APOL1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

APOL1基因编码载脂蛋白L1,参与脂质代谢和先天免疫,其变异与非洲裔人群的慢性肾脏病和高血压相关肾病密切相关。

基因信息卡

基因符号 APOL1
基因全名 Apolipoprotein L1
基因类型 protein-coding
染色体位置 22q12.3
NCBI Gene ID 8542 ncbi.nlm.nih.gov/gene/8542
Ensembl ID ENSG00000134242
UniProt ID O14791
OMIM ID 603743
HGNC ID 618
基因别名 APOL-I; APOL1; apolipoprotein L1

基因功能与研究简介

APOL1基因编码载脂蛋白L1,属于载脂蛋白L家族。该蛋白在血浆中与高密度脂蛋白(HDL)结合,参与脂质代谢和先天免疫。APOL1的C端具有成孔结构域,可裂解锥虫的溶酶体膜,从而抵抗某些锥虫感染。此外,APOL1的G1和G2变异与非洲裔人群的慢性肾脏病(包括局灶节段性肾小球硬化和高血压相关肾病)密切相关,但其具体机制尚不完全清楚。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
局灶节段性肾小球硬化 APOL1 G1/G2变异导致蛋白构象改变,可能通过形成离子通道或影响自噬导致足细胞损伤 已明确致病
高血压相关肾病 APOL1 G1/G2变异增加高血压相关肾病的风险,机制可能与足细胞损伤和肾小管间质纤维化有关 已明确致病
HIV相关肾病 APOL1 G1/G2变异显著增加HIV感染患者发生HIV相关肾病的风险 已明确致病
非裔美国人慢性肾脏病 APOL1 G1/G2变异是非洲裔人群慢性肾脏病的重要遗传风险因素 已明确致病
锥虫病抵抗 APOL1野生型蛋白可裂解布氏锥虫,提供对非洲锥虫病的天然抵抗力 已明确致病

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
肝脏 暂无可靠数据 高表达
肾脏 暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 低表达
胎盘 暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
肾足细胞 暂无可靠数据 关键表达细胞
肝细胞 暂无可靠数据 主要表达细胞
肾小管上皮细胞 暂无可靠数据 表达
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
G1 (p.S342G, p.I384M) SNP 非洲裔人群频率约30-40% 功能获得性变异,增加肾脏病风险
G2 (p.N388del, p.Y389del) 缺失 非洲裔人群频率约10-20% 功能获得性变异,增加肾脏病风险
p.R229K SNP 低频 可能影响蛋白功能,但临床意义不明确
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

暂无明确证据表明APOL1功能缺失突变导致疾病。

Gain of Function(功能获得,GOF)

G1和G2变异被认为是功能获得性变异,可能通过形成异常离子通道或改变蛋白构象导致足细胞损伤。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明APOL1变异具有显性负效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0006955 immune response • GO:0006869 lipid transport
• GO:0016020 membrane • GO:0008289 lipid binding
• GO:0005576 extracellular region

相关通路

hsa04940 Type I diabetes mellitus
hsa05143 African trypanosomiasis

蛋白质功能简介

APOL1蛋白由398个氨基酸组成,包含一个N端信号肽、一个膜结合结构域和一个C端成孔结构域。该蛋白主要在肝脏合成,分泌到血液中与HDL结合。APOL1通过其C端结构域在锥虫溶酶体膜上形成孔道,导致锥虫死亡。在肾脏中,APOL1在足细胞中表达,其变异可能通过影响自噬、线粒体功能或离子稳态导致足细胞损伤。

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