APP基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

APP基因编码淀粉样前体蛋白,是阿尔茨海默病的关键致病基因,也是研究神经退行性疾病的重要靶点。

基因信息卡

基因符号 APP
基因全名 amyloid beta precursor protein
基因类型 protein-coding
染色体位置 21q21.3
NCBI Gene ID 351 ncbi.nlm.nih.gov/gene/351
Ensembl ID ENSG00000142192
UniProt ID P05067
OMIM ID 104760
HGNC ID 620
基因别名 AAA, ABETA, ABPP, AD1, APPI, CTFgamma, CVAP, PN-II, preA4

基因功能与研究简介

APP基因编码淀粉样前体蛋白(APP),是一种跨膜蛋白,广泛表达于多种组织,尤其在脑组织中高表达。APP在神经突触形成、细胞黏附、轴突运输等过程中发挥重要作用。APP经β-分泌酶和γ-分泌酶切割产生Aβ多肽,Aβ的异常聚集是阿尔茨海默病(AD)的主要病理特征。APP基因突变可导致早发性家族性阿尔茨海默病(EOFAD)和脑淀粉样血管病(CAA)。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
阿尔茨海默病 APP基因突变导致Aβ产生增加或聚集倾向增强,形成老年斑,引发神经毒性,导致认知功能障碍。 已明确致病
脑淀粉样血管病 APP基因突变导致Aβ在脑血管壁沉积,引起血管壁损伤,增加脑出血风险。 已明确致病
唐氏综合征 APP基因位于21号染色体,唐氏综合征患者因三体21导致APP基因剂量增加,Aβ过度产生,早发AD风险显著升高。 已明确致病
遗传性脑海绵状血管畸形 部分研究提示APP基因变异可能与该病相关,但证据尚不充分。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 中等表达
胰腺 暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经母细胞瘤细胞系,常用于AD研究
HEK293 暂无可靠数据 人胚肾细胞系,常用于APP加工研究
H4 暂无可靠数据 人神经胶质瘤细胞系,常用于APP研究
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
p.A673V 错义突变 罕见 降低Aβ产生,但可能增加聚集倾向
p.D678H 错义突变 罕见 影响APP加工,增加Aβ产生
p.E693G 错义突变 罕见 增加Aβ聚集,导致AD
p.E693K 错义突变 罕见 增加Aβ聚集,导致AD
p.I716V 错义突变 罕见 增加Aβ42/Aβ40比例,导致AD
p.V717I 错义突变 罕见 增加Aβ42/Aβ40比例,导致AD
p.L723P 错义突变 罕见 增加Aβ产生,导致AD
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

APP基因功能缺失突变较为罕见,可能导致APP蛋白功能部分丧失,但主要致病机制并非功能缺失。

Gain of Function(功能获得,GOF)

多数APP致病突变属于功能获得性突变,导致Aβ产生增加或聚集倾向增强,从而引发毒性。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

APP突变通常以显性方式发挥作用,但并非典型的显性负性突变,而是通过产生毒性Aβ片段致病。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 protein binding • GO:0008201 heparin binding
• GO:0005509 calcium ion binding • GO:0005886 plasma membrane
• GO:0005576 extracellular region • GO:0005615 extracellular space
• GO:0005794 Golgi apparatus • GO:0005783 endoplasmic reticulum
• GO:0005768 endosome • GO:0005887 integral component of plasma membrane
• GO:0007155 cell adhesion • GO:0007399 nervous system development
• GO:0007411 axon guidance • GO:0007612 learning
• GO:0007613 memory • GO:0008344 adult locomotory behavior
• GO:0008542 visual learning • GO:0010976 positive regulation of neuron projection development
• GO:0030154 cell differentiation • GO:0030424 axon
• GO:0030425 dendrite • GO:0030054 cell junction
• GO:0045202 synapse • GO:0043025 neuronal cell body
• GO:0043197 dendritic spine • GO:0045202 synapse
• GO:0048471 perinuclear region of cytoplasm • GO:0051082 unfolded protein binding
• GO:0051402 neuron apoptotic process • GO:0060076 excitatory synapse
• GO:0097060 synaptic membrane • GO:1902003 regulation of amyloid-beta formation

相关通路

Alzheimer's disease (KEGG: hsa05010)
Parkinson's disease (KEGG: hsa05012)
Prion disease (KEGG: hsa05020)
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Endocytosis (KEGG: hsa04144)
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MAPK signaling pathway (KEGG: hsa04010)
Wnt signaling pathway (KEGG: hsa04310)
Neurotrophin signaling pathway (KEGG: hsa04722)
Axon guidance (KEGG: hsa04360)

蛋白质功能简介

APP蛋白是一种I型跨膜蛋白,由770个氨基酸组成。其胞外区域包含一个大的N端结构域和一个Kunitz型蛋白酶抑制剂(KPI)结构域(在APP770亚型中)。APP经α-分泌酶和γ-分泌酶切割产生可溶性APPα(sAPPα)和P3肽,经β-分泌酶和γ-分泌酶切割产生sAPPβ和Aβ多肽。Aβ多肽(主要为Aβ40和Aβ42)在脑内聚集形成老年斑,是AD的核心病理特征。APP还参与突触形成、神经保护、细胞黏附等过程。

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