ARFGEF2基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

ARFGEF2编码BIG2蛋白,参与囊泡运输和神经元迁移,其突变与常染色体隐性遗传的脑室周围异位症相关。

基因信息卡

基因符号 ARFGEF2
基因全名 ADP ribosylation factor guanine nucleotide exchange factor 2
基因类型 protein-coding
染色体位置 20q13.13
NCBI Gene ID 10564 ncbi.nlm.nih.gov/gene/10564
Ensembl ID ENSG00000124198
UniProt ID Q9Y6D5
OMIM ID 605371
HGNC ID 15853
基因别名 BIG2, dJ1069N22.2

基因功能与研究简介

ARFGEF2基因编码BIG2蛋白,属于ADP核糖基化因子鸟嘌呤核苷酸交换因子(ARF-GEF)家族。BIG2主要定位于反式高尔基体网络,通过催化ARF1和ARF3的GDP-GTP交换,调控囊泡运输和膜转运。在神经发育中,BIG2参与神经元迁移和皮质层形成。ARFGEF2基因突变可导致常染色体隐性遗传的脑室周围异位症(PVNH),表现为神经元迁移障碍。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
脑室周围异位症(Periventricular Heterotopia) ARFGEF2基因突变导致BIG2蛋白功能缺失,影响神经元迁移,导致神经元未能迁移至皮质表面,形成异位灰质团块。 已明确致病
小头畸形(Microcephaly) 部分ARFGEF2突变患者伴有小头畸形,可能由于神经元迁移障碍影响脑发育。 具有较强研究证据
癫痫(Epilepsy) 脑室周围异位症常伴有癫痫发作,ARFGEF2突变导致的异位症患者中常见癫痫。 具有较强研究证据

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 中等表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经母细胞瘤细胞系
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
HEK293 暂无可靠数据 人胚胎肾细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.632A>G (p.Tyr211Cys) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能
c.1045C>T (p.Arg349Ter) 无义突变 罕见 导致蛋白截短,功能丧失
c.1321G>A (p.Gly441Arg) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

ARFGEF2突变导致BIG2蛋白功能缺失或降低,影响ARF1/3激活和囊泡运输,导致神经元迁移障碍。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明ARFGEF2突变具有功能获得效应。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明ARFGEF2突变具有显性负效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005086 - ARF guanyl-nucleotide exchange factor activity • GO:0005794 - Golgi apparatus
• GO:0006886 - intracellular protein transport • GO:0007264 - small GTPase mediated signal transduction

相关通路

ARF signaling pathway
Vesicle-mediated transport

蛋白质功能简介

BIG2蛋白是ARF-GEF家族成员,主要定位于反式高尔基体网络,通过催化ARF1和ARF3的GDP-GTP交换,调控囊泡运输和膜转运。在神经发育中,BIG2参与神经元迁移和皮质层形成。ARFGEF2基因突变导致BIG2功能缺失,影响神经元迁移,导致脑室周围异位症。

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