ARHGAP42基因|基因功能、疾病关联、突变与表达研究

ARHGAP42编码Rho GTPase激活蛋白,调控细胞骨架和血管平滑肌收缩,与高血压等疾病相关。

基因信息卡

基因符号 ARHGAP42
基因全名 Rho GTPase activating protein 42
基因类型 protein-coding
染色体位置 11p11.2
NCBI Gene ID 143872 ncbi.nlm.nih.gov/gene/143872
Ensembl ID ENSG00000182158
UniProt ID A6NGB0
OMIM ID 616300
HGNC ID 26545
基因别名 GRAF2, FLJ40451

基因功能与研究简介

ARHGAP42(Rho GTPase activating protein 42)编码一个Rho GTPase激活蛋白,属于GRAF家族。该蛋白通过激活Rho GTPase的GTP水解活性,负性调控RhoA等信号通路,从而影响细胞骨架重组、细胞迁移和收缩。ARHGAP42在血管平滑肌细胞中高表达,参与调控血管张力,与高血压等心血管疾病相关。此外,ARHGAP42可能参与肿瘤发生,但具体机制尚在研究中。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
高血压 ARHGAP42通过调控RhoA活性影响血管平滑肌收缩,基因变异可能影响血压调节。 GWAS关联,功能研究
癌症 ARHGAP42表达异常可能影响细胞迁移和侵袭,与多种癌症相关,但证据尚不充分。 表达谱分析,初步功能研究

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
血管平滑肌 暂无可靠数据 高表达
心脏 暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 中等表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
血管平滑肌细胞 暂无可靠数据 高表达
内皮细胞 暂无可靠数据 低表达
成纤维细胞 暂无可靠数据 中等表达
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
rs11222084 SNV 常见(MAF>0.1) 位于内含子,可能影响剪接或调控,与高血压相关
rs61734410 错义突变 低频 可能影响蛋白功能,但临床意义未明确
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失型突变可能导致RhoA活性增强,血管平滑肌收缩异常,与高血压相关。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变可能增强GAP活性,过度抑制RhoA,影响细胞骨架和迁移,但证据有限。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变可能干扰正常蛋白功能,但尚未有明确报道。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005096 GTPase activator activity • GO:0005737 cytoplasm
• GO:0030029 actin filament-based process • GO:0043547 positive regulation of GTPase activity

相关通路

Rho GTPase cycle (Reactome: R-HSA-194840)
Signaling by Rho GTPases (Reactome: R-HSA-194315)

蛋白质功能简介

ARHGAP42蛋白包含一个RhoGAP结构域,能够催化RhoA从GTP结合状态转变为GDP结合状态,从而负性调控RhoA信号。该蛋白在血管平滑肌细胞中高表达,通过抑制RhoA活性调节肌球蛋白轻链磷酸化,影响血管收缩。此外,ARHGAP42可能参与细胞迁移和肿瘤抑制,但具体机制尚需进一步研究。

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