ARL13A基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
ARL13A编码ADP核糖基化因子样蛋白13A,参与纤毛发生和信号转导,其突变与纤毛病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | ARL13A |
|---|---|
| 基因全名 | ADP ribosylation factor like GTPase 13A |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | Xq22.1 |
| NCBI Gene ID | 84129 ncbi.nlm.nih.gov/gene/84129 |
| Ensembl ID | ENSG00000169313 |
| UniProt ID | Q5H913 |
| OMIM ID | 300406 |
| HGNC ID | 24055 |
| 基因别名 | ARL13, ARL2L1, JBTS8 |
基因功能与研究简介
ARL13A基因编码ADP核糖基化因子样蛋白13A,属于ARF家族的小GTP酶。该蛋白定位于初级纤毛,参与纤毛发生、纤毛内运输和信号转导,如Hedgehog信号通路。ARL13A突变与Joubert综合征8型(JBTS8)相关,该病是一种纤毛病,表现为小脑蚓部发育不良、智力障碍等。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| Joubert综合征8型 | ARL13A突变导致纤毛功能异常,影响Hedgehog信号通路,导致小脑和脑干发育异常。 | 已明确致病 |
| 肾消耗病 | ARL13A突变可能影响肾小管纤毛功能,导致肾囊肿,但证据尚不充分。 | 潜在关联 |
| 视网膜变性 | ARL13A在视网膜光感受器纤毛中表达,突变可能导致视网膜变性,但证据有限。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肾 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| hTERT-RPE1 | 暂无可靠数据 | 纤毛研究常用细胞系 |
| IMCD3 | 暂无可靠数据 | 肾集合管细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.239G>A (p.Arg80His) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响GTP结合或水解,导致功能丧失 |
| c.475C>T (p.Arg159Ter) | 无义突变 | 罕见 | 导致截短蛋白,功能丧失 |
| c.626A>G (p.Tyr209Cys) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白稳定性或定位 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
ARL13A突变导致蛋白功能丧失,影响纤毛发生和信号转导。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003924 (GTPase activity) | • GO:0005525 (GTP binding) |
| • GO:0005813 (centrosome) | • GO:0005929 (cilium) |
| • GO:0036064 (ciliary basal body) | • GO:0007224 (smoothened signaling pathway) |
相关通路
• Hedgehog signaling pathway (hsa04340)
蛋白质功能简介
ARL13A蛋白属于ARF样小GTP酶家族,定位于初级纤毛的轴丝和基体。它通过调节纤毛内运输和信号转导,特别是Hedgehog信号通路,在纤毛发生和胚胎发育中发挥关键作用。ARL13A突变导致纤毛功能障碍,与Joubert综合征等纤毛病相关。