ASXL1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
ASXL1是表观遗传调控关键基因,其突变与骨髓增生异常综合征、急性髓系白血病等髓系恶性肿瘤密切相关。
基因信息卡
| 基因符号 | ASXL1 |
|---|---|
| 基因全名 | ASXL transcriptional regulator 1 |
| 基因类型 | 蛋白编码基因 |
| 染色体位置 | 20q11.21 |
| NCBI Gene ID | 171023 ncbi.nlm.nih.gov/gene/171023 |
| Ensembl ID | ENSG00000171456 |
| UniProt ID | Q8IXJ9 |
| OMIM ID | 612990 |
| HGNC ID | 18318 |
| 基因别名 | MGC104624, MGC117215, MGC126232, MGC126233, MGC126234, ASXL1 |
基因功能与研究简介
ASXL1基因编码ASXL转录调控因子1,是Polycomb家族相关蛋白,参与组蛋白修饰和基因转录调控。ASXL1在造血干细胞中高表达,对维持造血稳态至关重要。ASXL1功能缺失突变常见于髓系恶性肿瘤,如骨髓增生异常综合征(MDS)、急性髓系白血病(AML)等,与不良预后相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 骨髓增生异常综合征 | ASXL1功能缺失突变导致表观遗传调控异常,影响造血干细胞分化,促进疾病发生。 | 已明确致病 |
| 急性髓系白血病 | ASXL1突变在AML中常见,与预后不良相关,可能通过异常表观遗传调控促进白血病发生。 | 已明确致病 |
| 慢性粒单核细胞白血病 | ASXL1突变在CMML中高频出现,参与疾病进展。 | 已明确致病 |
| 骨髓增殖性肿瘤 | ASXL1突变在MPN中可见,可能影响疾病表型。 | 具有较强研究证据 |
| 实体瘤 | ASXL1突变在部分实体瘤中检出,但关联性尚不明确。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 骨髓 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 外周血 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 脾脏 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 胸腺 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| K562 | 暂无可靠数据 | 白血病细胞系 |
| HL-60 | 暂无可靠数据 | 白血病细胞系 |
| MOLM-13 | 暂无可靠数据 | AML细胞系 |
| THP-1 | 暂无可靠数据 | 单核细胞白血病细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1934dupG (p.Gly646TrpfsTer12) | 移码突变 | 常见于MDS/AML | 功能缺失 |
| c.2077C>T (p.Gln693Ter) | 无义突变 | 常见于MDS/AML | 功能缺失 |
| c.2035C>T (p.Arg679Ter) | 无义突变 | 常见于MDS/AML | 功能缺失 |
| c.1900_1902del (p.Glu634del) | 框内缺失 | 少见 | 可能功能缺失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
ASXL1突变多为功能缺失型,导致蛋白截短或降解,丧失正常转录调控功能。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明ASXL1突变具有功能获得效应。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
部分突变可能具有显性负效应,干扰野生型ASXL1功能,但证据有限。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005634 (nucleus) | • GO:0005515 (protein binding) |
| • GO:0006325 (chromatin organization) | • GO:0045892 (negative regulation of transcription |
| • DNA-templated) | • GO:0006355 (regulation of transcription |
| • DNA-templated) |
相关通路
• hsa05202 (Transcriptional misregulation in cancer)
• hsa05166 (Human T-cell leukemia virus 1 infection)
蛋白质功能简介
ASXL1蛋白包含ASXH结构域和PHD finger结构域,参与组蛋白修饰(如H2AK119去泛素化)和基因转录调控。ASXL1与PRC1复合物相互作用,调节靶基因表达。ASXL1功能缺失导致表观遗传异常,影响造血干细胞自我更新和分化,促进髓系恶性肿瘤发生。