ATAD5基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
ATAD5是维持基因组稳定性的关键基因,其突变与多种癌症风险相关。
基因信息卡
| 基因符号 | ATAD5 |
|---|---|
| 基因全名 | ATPase family AAA domain containing 5 |
| 基因类型 | 蛋白编码基因 |
| 染色体位置 | 17q11.2 |
| NCBI Gene ID | 79915 ncbi.nlm.nih.gov/gene/79915 |
| Ensembl ID | ENSG00000108771 |
| UniProt ID | Q96QE3 |
| OMIM ID | 612407 |
| HGNC ID | 25727 |
| 基因别名 | ELG1, FRAG1, C17orf41 |
基因功能与研究简介
ATAD5(ATPase family AAA domain containing 5)编码一种AAA-ATP酶家族蛋白,是复制因子C(RFC)复合物的替代亚基,参与DNA复制和损伤应答。ATAD5在维持基因组稳定性中发挥关键作用,通过调节PCNA的去泛素化,影响DNA损伤修复和细胞周期检查点。ATAD5功能缺失与基因组不稳定和肿瘤发生相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 子宫内膜癌 | ATAD5突变导致基因组不稳定,增加子宫内膜癌风险。 | ClinVar, COSMIC |
| 卵巢癌 | ATAD5突变与卵巢癌风险相关,可能通过影响DNA修复。 | ClinVar, COSMIC |
| 乳腺癌 | ATAD5突变可能增加乳腺癌风险,但证据尚不充分。 | ClinVar |
| 结直肠癌 | ATAD5突变与结直肠癌风险相关,但机制尚不明确。 | ClinVar |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 骨髓 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 卵巢 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1234A>G (p.Thr412Ala) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能,但致病性未明确 |
| c.4567C>T (p.Arg1523Ter) | 无义突变 | 罕见 | 导致截短蛋白,可能为Loss of Function |
| c.7890_7891insA (p.Val2631SerfsTer5) | 移码突变 | 罕见 | 导致截短蛋白,可能为Loss of Function |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
Loss of Function(功能缺失):ATAD5突变导致蛋白功能丧失,影响DNA修复和基因组稳定性,增加癌症风险。
Gain of Function(功能获得,GOF)
Gain of Function(功能获得):目前暂无明确证据表明ATAD5存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
Dominant Negative(显性负性):目前暂无明确证据表明ATAD5突变具有显性负性效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005524 (ATP binding) | • GO:0006281 (DNA repair) |
| • GO:0006974 (cellular response to DNA damage stimulus) | • GO:0005634 (nucleus) |
| • GO:0005663 (DNA replication factor C complex) |
相关通路
• DNA repair
• DNA replication
• Fanconi anemia pathway
蛋白质功能简介
ATAD5蛋白属于AAA-ATP酶家族,包含AAA结构域和PCNA相互作用区域。它作为RFC复合物的替代亚基,参与PCNA的去泛素化,调节DNA损伤修复和复制叉稳定性。ATAD5在维持基因组稳定性中起关键作用,其功能缺失与肿瘤发生相关。