ATF1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

ATF1是CREB/ATF家族转录因子,参与细胞增殖、分化与应激反应,其基因融合与多种肿瘤相关。

基因信息卡

基因符号 ATF1
基因全名 activating transcription factor 1
基因类型 protein-coding
染色体位置 12q13.12
NCBI Gene ID 466 ncbi.nlm.nih.gov/gene/466
Ensembl ID ENSG00000123268
UniProt ID P18846
OMIM ID 189972
HGNC ID 783
基因别名 TREB36; cAMP-dependent transcription factor ATF-1

基因功能与研究简介

ATF1(激活转录因子1)是CREB/ATF家族成员,作为转录因子,通过结合cAMP响应元件(CRE)调控基因表达。ATF1参与细胞增殖、分化、凋亡和应激反应等过程。在多种肿瘤中,ATF1与其他基因(如EWSR1、FUS)发生融合,产生致癌融合蛋白,导致异常转录调控。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
血管瘤样纤维组织细胞瘤 EWSR1-ATF1融合基因导致异常转录激活,促进肿瘤发生 已明确致病
透明细胞肉瘤 EWSR1-ATF1融合基因是主要分子特征,驱动肿瘤发生 已明确致病
血管瘤样纤维组织细胞瘤 FUS-ATF1融合基因罕见,但同样致病 已明确致病
黑色素瘤 ATF1表达异常可能参与肿瘤进展,但证据有限 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 暂无可靠数据
心脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
肝脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
肾脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
A549 暂无可靠数据 肺癌细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
EWSR1-ATF1融合 基因融合 在血管瘤样纤维组织细胞瘤中常见 产生融合蛋白,异常激活转录
FUS-ATF1融合 基因融合 罕见 产生融合蛋白,异常激活转录
ATF1点突变 错义突变 暂无可靠数据 暂无明确证据
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

暂无明确证据

Gain of Function(功能获得,GOF)

EWSR1-ATF1和FUS-ATF1融合蛋白具有异常转录激活功能,属于功能获得性突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003677 DNA binding • GO:0003700 DNA-binding transcription factor activity
• GO:0005634 nucleus • GO:0006355 regulation of transcription
• DNA-templated • GO:0045944 positive regulation of transcription by RNA polymerase II

相关通路

hsa04022 cGMP-PKG signaling pathway
hsa04024 cAMP signaling pathway
hsa04910 Insulin signaling pathway

蛋白质功能简介

ATF1蛋白属于bZIP转录因子家族,包含碱性亮氨酸拉链结构域,可形成同源或异源二聚体,结合DNA上的CRE位点。ATF1在细胞核内调控基因表达,参与细胞周期、凋亡和代谢等过程。其融合蛋白(如EWSR1-ATF1)保留DNA结合域,但激活域异常,导致靶基因异常表达。

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