ATF5基因｜基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
ATF5是调控细胞应激反应、神经发育和肿瘤发生的关键转录因子，在多种癌症中异常表达，是潜在的治疗靶点。
基因信息卡
| 基因符号 | ATF5 |
|---|---|
| 基因全名 | activating transcription factor 5 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 19q13.33 |
| NCBI Gene ID | 22809 ncbi.nlm.nih.gov/gene/22809 |
| Ensembl ID | ENSG00000169136 |
| UniProt ID | Q9Y2D1 |
| OMIM ID | 606399 |
| HGNC ID | 790 |
| 基因别名 | HMFN0395; ATFX |
基因功能与研究简介
ATF5（activating transcription factor 5）是ATF/CREB转录因子家族成员，参与调控细胞增殖、分化、凋亡和应激反应。ATF5在多种组织中表达，尤其在脑、肝和睾丸中高表达。研究表明，ATF5在多种癌症中过表达，与肿瘤发生、发展和耐药性相关。此外，ATF5在神经发育和神经保护中发挥重要作用。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 胶质母细胞瘤 | ATF5在胶质母细胞瘤中高表达，通过抑制凋亡和促进细胞存活促进肿瘤生长。 | 较强研究证据 |
| 肝细胞癌 | ATF5在肝细胞癌中表达上调，与不良预后相关，可能通过调控细胞周期和凋亡参与肿瘤进展。 | 较强研究证据 |
| 乳腺癌 | ATF5在乳腺癌中表达异常，可能通过调控上皮-间质转化（EMT）影响肿瘤侵袭和转移。 | 潜在关联 |
| 神经退行性疾病 | ATF5参与神经元应激反应，可能对神经退行性疾病具有保护作用，但具体机制尚不明确。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 肝 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肾 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| U87MG（胶质母细胞瘤） | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| HepG2（肝癌） | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| MCF7（乳腺癌） | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| HEK293（胚胎肾） | 暂无可靠数据 | 低表达 |
数据来源：Human Protein Atlas（proteinatlas.org）
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1A>G (p.Met1Val) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白翻译起始，导致功能异常 |
| c.457C>T (p.Arg153Trp) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响DNA结合域，改变转录活性 |
| c.1000G>A (p.Glu334Lys) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白稳定性或相互作用 |
突变功能分类
Loss of Function（功能缺失，LOF）
功能缺失型突变：导致ATF5蛋白表达减少或功能丧失，可能影响细胞应激反应和凋亡调控。
Gain of Function（功能获得，GOF）
功能获得型突变：增强ATF5的转录活性或稳定性，可能促进细胞增殖和肿瘤发生。
Dominant Negative（显性负效应，DN）
显性负性突变：突变蛋白干扰野生型ATF5的功能，可能影响下游基因表达。
查看完整突变数据：
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003677 DNA binding | • GO:0003700 DNA-binding transcription factor activity |
| • GO:0005515 protein binding | • GO:0005634 nucleus |
| • GO:0005737 cytoplasm | • GO:0006355 regulation of transcription |
| • DNA-templated | • GO:0006915 apoptotic process |
| • GO:0006950 response to stress | • GO:0043066 negative regulation of apoptotic process |
相关通路
• hsa04210 Apoptosis
• hsa04068 FoxO signaling pathway
• hsa05200 Pathways in cancer
蛋白质功能简介
ATF5蛋白属于ATF/CREB转录因子家族，包含一个碱性亮氨酸拉链（bZIP）结构域，能够结合DNA并调控基因表达。ATF5在细胞应激反应中发挥关键作用，通过调控凋亡相关基因的表达影响细胞存活。在肿瘤中，ATF5的过表达与不良预后相关，可能通过抑制凋亡和促进细胞增殖促进肿瘤进展。此外，ATF5在神经发育中具有重要功能，参与神经元的分化和存活。
联系电话