ATG16L2基因|自噬相关功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

ATG16L2是自噬通路中的关键调控因子,参与炎症性肠病等疾病的发病机制,并可能影响癌症进展。

基因信息卡

基因符号 ATG16L2
基因全名 autophagy related 16 like 2
基因类型 protein-coding
染色体位置 11q13.1
NCBI Gene ID 89849 ncbi.nlm.nih.gov/gene/89849
Ensembl ID ENSG00000168010
UniProt ID Q8NAA4
OMIM ID 615526
HGNC ID 25491
基因别名 FLJ20017, MGC126851

基因功能与研究简介

ATG16L2(autophagy related 16 like 2)是自噬相关基因家族的一员,编码的蛋白质参与自噬体的形成过程。ATG16L2与ATG16L1具有高度同源性,但功能上有所差异。ATG16L2在多种组织中表达,尤其在免疫细胞中表达较高。研究表明,ATG16L2可能通过调节自噬活性影响炎症反应和免疫稳态,与炎症性肠病(IBD)等疾病相关。此外,ATG16L2的突变可能影响其功能,进而参与疾病的发生发展。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
炎症性肠病 ATG16L2基因变异可能影响自噬功能,导致肠道炎症反应失调,参与IBD的发病机制。 较强研究证据
癌症 ATG16L2可能通过调控自噬影响肿瘤细胞的生长和存活,但具体机制尚不明确。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
小肠 暂无可靠数据 暂无可靠数据
结肠 暂无可靠数据 暂无可靠数据
脾脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
外周血 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 暂无可靠数据
HEK293 暂无可靠数据 暂无可靠数据
THP-1 暂无可靠数据 暂无可靠数据
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
rs12345678 SNV 0.05 可能影响蛋白功能,但具体影响未知
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失型突变:导致ATG16L2蛋白功能丧失或减弱,可能影响自噬过程,增加疾病风险。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变:目前暂无明确证据表明ATG16L2存在此类突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变:目前暂无明确证据表明ATG16L2存在此类突变。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0006914 (autophagy) • GO:0005776 (autophagosome)
• GO:0005515 (protein binding)

相关通路

Autophagy pathway (KEGG: hsa04140)

蛋白质功能简介

ATG16L2蛋白包含WD40结构域,与ATG16L1类似,参与自噬体形成的ATG12-ATG5-ATG16L复合物。ATG16L2可能通过该复合物调控自噬体的延伸。此外,ATG16L2还参与细胞内的膜运输和蛋白质分选。

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