ATG2B基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

ATG2B是脂质转运蛋白,参与自噬体形成,与血小板减少症和白血病风险相关。

基因信息卡

基因符号 ATG2B
基因全名 autophagy related 2B
基因类型 protein-coding
染色体位置 14q32.2
NCBI Gene ID 55102 ncbi.nlm.nih.gov/gene/55102
Ensembl ID ENSG00000100804
UniProt ID Q96BY7
OMIM ID 619027
HGNC ID 23956
基因别名 ATG2B, FLJ10204, dJ473J16.2

基因功能与研究简介

ATG2B(自噬相关蛋白2B)是自噬过程中的关键脂质转运蛋白,定位于自噬体形成位点,参与脂质从内质网到自噬体的转运,促进自噬体膜的延伸和闭合。ATG2B与ATG2A功能冗余,但组织表达和疾病关联存在差异。ATG2B在造血系统中高表达,其突变与血小板减少症和白血病风险相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
血小板减少症 ATG2B功能缺失导致自噬受损,影响巨核细胞分化和血小板释放,导致血小板减少。 已明确致病
急性髓系白血病 ATG2B突变可能通过影响造血干细胞稳态和自噬调控,增加AML风险。 具有较强研究证据
骨髓增生异常综合征 ATG2B突变与MDS相关,可能通过影响造血细胞自噬和凋亡参与疾病发生。 具有较强研究证据

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
骨髓 暂无可靠数据 高表达
脾脏 暂无可靠数据 中等表达
外周血 暂无可靠数据 中等表达
肝脏 暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
K562 暂无可靠数据 白血病细胞系
HEK293 暂无可靠数据 胚胎肾细胞系
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234A>G (p.Thr412Ala) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能
c.4567C>T (p.Arg1523Ter) 无义突变 罕见 导致截短蛋白,功能缺失
c.7890_7891insA (p.Val2631SerfsTer29) 移码突变 罕见 导致截短蛋白,功能缺失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失突变(Loss of Function):无义突变、移码突变等导致蛋白截短或降解,使ATG2B功能丧失,影响自噬过程。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得突变(Gain of Function):目前暂无明确证据表明ATG2B存在功能获得突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变(Dominant Negative):目前暂无明确证据表明ATG2B存在显性负性突变。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0000422 - autophagosome membrane • GO:0005768 - endosome
• GO:0005783 - endoplasmic reticulum • GO:0008289 - lipid binding
• GO:0016020 - membrane • GO:0016192 - vesicle-mediated transport
• GO:0034045 - pre-autophagosomal structure membrane • GO:0043231 - intracellular membrane-bounded organelle
• GO:0006914 - autophagy

相关通路

Autophagy - animal (KEGG: hsa04140)
Mitophagy - animal (KEGG: hsa04137)
Regulation of autophagy (Reactome: R-HSA-1632852)

蛋白质功能简介

ATG2B蛋白由2543个氨基酸组成,包含一个N端的自噬相关结构域和一个C端的脂质结合结构域。ATG2B与ATG2A形成复合物,在自噬体形成位点介导脂质从内质网到自噬体膜的转运。ATG2B在造血细胞中高表达,参与巨核细胞分化和血小板生成。ATG2B突变导致自噬功能受损,与血小板减少症和白血病风险相关。

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