ATG9B基因|自噬相关功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

ATG9B是自噬核心机制中的关键蛋白,参与自噬体形成,其变异与多种疾病相关。

基因信息卡

基因符号 ATG9B
基因全名 autophagy related 9B
基因类型 protein-coding
染色体位置 7q36.1
NCBI Gene ID 285973 ncbi.nlm.nih.gov/gene/285973
Ensembl ID ENSG00000106462
UniProt ID Q674R7
OMIM ID 612204
HGNC ID 22422
基因别名 FLJ10853, MGC33114

基因功能与研究简介

ATG9B是自噬相关蛋白9家族的一员,参与自噬体形成的早期步骤。ATG9B编码的蛋白质是一种跨膜蛋白,在自噬过程中负责将膜脂质运输到自噬体形成位点。ATG9B在多种组织中表达,尤其在脑、心脏和骨骼肌中高表达。研究表明,ATG9B的变异与多种疾病相关,包括癌症、神经退行性疾病和代谢性疾病。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
癌症 ATG9B在自噬中发挥作用,可能影响肿瘤细胞的生存和增殖。研究表明,ATG9B的表达水平与某些癌症的预后相关。 较强研究证据
神经退行性疾病 自噬功能障碍与神经退行性疾病相关,ATG9B可能参与其中。 潜在关联
代谢性疾病 自噬在代谢调节中起重要作用,ATG9B变异可能影响代谢稳态。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
心脏 暂无可靠数据 高表达
骨骼肌 暂无可靠数据 高表达
肝脏 暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 中等表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
HEK293 暂无可靠数据 胚胎肾细胞系
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经母细胞瘤细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
rs1470652 SNV 未知 可能影响ATG9B表达或功能,需进一步研究
rs2293870 SNV 未知 可能影响ATG9B功能,与疾病关联待验证
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失型突变可能导致自噬功能受损,影响细胞稳态。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变可能增强自噬活性,但具体影响需研究。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变可能干扰正常ATG9B功能,但证据不足。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0006914 (autophagy) • GO:0005776 (autophagosome)
• GO:0016021 (integral component of membrane) • GO:0005515 (protein binding)

相关通路

hsa04140 (Autophagy - animal)
hsa04136 (Autophagy - other)

蛋白质功能简介

ATG9B蛋白是一种跨膜蛋白,参与自噬体形成的早期步骤。它通过循环ATG9A/B复合物将膜脂质运输到自噬体形成位点,从而促进自噬体的延伸和闭合。ATG9B在多种组织中表达,尤其在脑、心脏和骨骼肌中高表达。研究表明,ATG9B的变异可能影响自噬功能,进而与多种疾病相关。

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