ATL3基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
ATL3基因编码发动蛋白样GTP酶,参与内质网形态维持,其突变与遗传性感觉神经病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | ATL3 |
|---|---|
| 基因全名 | atlastin GTPase 3 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 11q13.1 |
| NCBI Gene ID | 25923 ncbi.nlm.nih.gov/gene/25923 |
| Ensembl ID | ENSG00000144746 |
| UniProt ID | Q6DD88 |
| OMIM ID | 609369 |
| HGNC ID | 24526 |
| 基因别名 | ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 5; ARL6IP5; SPG3A-like protein |
基因功能与研究简介
ATL3基因编码atlastin GTPase 3蛋白,属于发动蛋白样GTP酶家族,主要定位于内质网,参与内质网形态的维持和融合。ATL3突变与遗传性感觉神经病1型(HSN1)相关,该病以远端感觉神经退行性变为特征。ATL3在神经系统中高表达,其功能异常可能导致内质网应激和轴突运输障碍。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 遗传性感觉神经病1型(Hereditary Sensory Neuropathy type 1, HSN1) | ATL3突变导致内质网融合异常,影响感觉神经元功能,导致远端感觉丧失和自主神经症状。 | 已明确致病 |
| 痉挛性截瘫(Spastic Paraplegia) | 部分ATL3突变可能影响轴突运输,与痉挛性截瘫相关,但证据有限。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 脊髓 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 外周神经 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 其他组织 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| SH-SY5Y | 暂无可靠数据 | 神经母细胞瘤细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 胚胎肾细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.106C>T (p.Arg36Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.107G>A (p.Arg36Gln) | 错义突变 | 罕见 | 可能为Dominant Negative |
| c.112C>T (p.Arg38Trp) | 错义突变 | 罕见 | 可能为Dominant Negative |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
无义突变导致截短蛋白,功能丧失,破坏内质网融合。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
错义突变可能产生显性负效应,干扰正常蛋白功能。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003924 GTPase activity | • GO:0005525 GTP binding |
| • GO:0005783 endoplasmic reticulum | • GO:0005789 endoplasmic reticulum membrane |
| • GO:0016020 membrane | • GO:0042802 identical protein binding |
| • GO:0046872 metal ion binding |
相关通路
• Endoplasmic reticulum membrane fusion (Reactome: R-HSA-964739)
• GTPase cycle (Reactome: R-HSA-9012999)
蛋白质功能简介
ATL3蛋白属于atlastin家族,包含GTPase结构域和跨膜结构域,定位于内质网膜,介导内质网同型融合。ATL3与ATL1和ATL2功能冗余,但ATL3在感觉神经元中尤为重要。其突变导致内质网形态异常,影响轴突运输,最终导致神经退行性变。
相关产品
| 产品名称 | 货号 | 物种 | 基因 ID | |
|---|---|---|---|---|
| GLYATL3基因敲除HEK293细胞 | EDJ-KQ13613 | 人 | 389396 | 详情 立即询价 |
| ATL3基因敲除HEK293细胞 | EDJ-KQ8302 | 人 | 25923 | 详情 立即询价 |
| ATL3基因敲除HCT116细胞 | EDJ-KQ34271 | 人 | 25923 | 详情 立即询价 |
| ATL3基因敲除A549细胞 | EDJ-KQ34270 | 人 | 25923 | 详情 立即询价 |
| ATL3基因敲除Hela细胞 | EDJ-KQ34272 | 人 | 25923 | 详情 立即询价 |
| GLYATL3基因敲除HCT116细胞 | EDJ-KQ76923 | 人 | 389396 | 详情 立即询价 |
| GLYATL3基因敲除A549细胞 | EDJ-KQ68548 | 人 | 389396 | 详情 立即询价 |
| GLYATL3基因敲除Hela细胞 | EDJ-KQ60084 | 人 | 389396 | 详情 立即询价 |
Displaying Records 1 To 8 Of 8 Records