ATP6V1F基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
ATP6V1F编码V-ATP酶V1结构域F亚基,对溶酶体酸化和细胞稳态至关重要,其突变与神经发育障碍相关。
基因信息卡
| 基因符号 | ATP6V1F |
|---|---|
| 基因全名 | ATPase H+ Transporting V1 Subunit F |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 7q32.1 |
| NCBI Gene ID | 9296 ncbi.nlm.nih.gov/gene/9296 |
| Ensembl ID | ENSG00000128524 |
| UniProt ID | Q16864 |
| OMIM ID | 603643 |
| HGNC ID | 862 |
| 基因别名 | VATF, V-ATPase F subunit, ATP6F |
基因功能与研究简介
ATP6V1F基因编码液泡型H+-ATP酶(V-ATP酶)V1结构域的F亚基。V-ATP酶是多亚基复合物,负责将质子泵入细胞器(如溶酶体、内体)和细胞外空间,从而维持细胞器酸化和pH稳态。F亚基是V1结构域的组成部分,参与ATP水解和质子转运的偶联。ATP6V1F在多种组织中表达,尤其在肾脏、脑和骨骼肌中丰富。该基因的突变可能导致V-ATP酶功能受损,进而影响溶酶体功能、神经发育等。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 发育性癫痫性脑病 | ATP6V1F基因突变导致V-ATP酶功能异常,影响神经元突触囊泡酸化和神经递质释放,可能致病。 | ClinVar |
| 常染色体隐性遗传病 | 纯合或复合杂合突变导致V-ATP酶功能丧失,可能引起多系统症状。 | 暂无明确证据 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 肾脏 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 骨骼肌 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 心脏 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| SH-SY5Y | 暂无可靠数据 | 神经母细胞瘤细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.346C>T (p.Arg116Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.238A>G (p.Thr80Ala) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白稳定性 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能丧失型突变,导致F亚基功能缺失或蛋白截短,影响V-ATP酶组装和活性。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明ATP6V1F存在功能获得型突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明ATP6V1F存在显性负效应突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005524 (ATP binding) | • GO:0016787 (hydrolase activity) |
| • GO:0005886 (plasma membrane) | • GO:0016020 (membrane) |
| • GO:0033178 (proton-transporting V-type ATPase | • V1 domain) |
| • GO:0007034 (vacuolar transport) | • GO:0006886 (intracellular protein transport) |
相关通路
• Oxidative phosphorylation (hsa00190)
• Synaptic vesicle cycle (hsa04721)
• Collecting duct acid secretion (hsa04966)
蛋白质功能简介
ATP6V1F蛋白是V-ATP酶V1结构域的F亚基,分子量约13 kDa。F亚基与V1结构域的其他亚基相互作用,参与ATP水解和质子转运的偶联。该蛋白在进化上高度保守,在酵母、植物和哺乳动物中均有同源物。