ATXN1基因｜基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
ATXN1基因编码ataxin-1蛋白，参与转录调控和RNA代谢，其CAG重复扩增导致脊髓小脑性共济失调1型（SCA1），是神经退行性疾病研究的重要靶点。
基因信息卡
| 基因符号 | ATXN1 |
|---|---|
| 基因全名 | ataxin 1 |
| 基因类型 | protein coding |
| 染色体位置 | 6p22.3 |
| NCBI Gene ID | 6310 ncbi.nlm.nih.gov/gene/6310 |
| Ensembl ID | ENSG00000124788 |
| UniProt ID | P54253 |
| OMIM ID | 601556 |
| HGNC ID | 10548 |
| 基因别名 | SCA1, ATX1, D6S504E |
基因功能与研究简介
ATXN1基因编码ataxin-1蛋白，该蛋白广泛表达于多种组织，尤其在脑组织中高表达。ataxin-1参与转录调控、RNA加工和信号转导等过程。ATXN1基因外显子8中的CAG三核苷酸重复扩增（正常范围6-35次，致病范围39次以上）导致脊髓小脑性共济失调1型（SCA1），这是一种常染色体显性遗传的神经退行性疾病，主要影响小脑、脑干和脊髓，导致进行性共济失调、构音障碍和眼球运动异常。此外，ATXN1的异常表达或突变还与某些癌症和神经发育障碍相关，但证据尚不充分。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 脊髓小脑性共济失调1型（SCA1） | ATXN1基因CAG重复扩增导致ataxin-1蛋白获得毒性功能，引起小脑Purkinje细胞等神经元变性 | 已明确致病（OMIM 164400） |
| 癌症（潜在关联） | ATXN1表达异常可能影响细胞增殖和凋亡，与某些癌症相关，但机制尚不明确 | 潜在关联（COSMIC） |
| 神经发育障碍（潜在关联） | ATXN1基因突变可能影响神经发育，与自闭症等疾病相关，但证据有限 | 潜在关联（ClinVar） |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 小脑 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 大脑皮层 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 心脏 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| SH-SY5Y | 暂无可靠数据 | 神经母细胞瘤细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 人胚肾细胞系 |
数据来源：Human Protein Atlas（proteinatlas.org）
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| CAG重复扩增（>39次） | 三核苷酸重复扩增 | 致病性变异 | 获得毒性功能（Gain of Function） |
| c.433C>T (p.Arg145Ter) | 无义突变 | 罕见 | 功能丧失（Loss of Function） |
| c.776A>G (p.Asp259Gly) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能 |
突变功能分类
Loss of Function（功能缺失，LOF）
功能丧失型突变，如无义突变导致截短蛋白，可能影响ataxin-1的正常功能，但ATXN1单倍剂量不足的致病性尚不明确。
Gain of Function（功能获得，GOF）
功能获得型突变，如CAG重复扩增导致ataxin-1蛋白获得毒性功能，是SCA1的主要致病机制。
Dominant Negative（显性负效应，DN）
显性负性效应，目前尚无明确证据表明ATXN1突变通过显性负性效应致病。
查看完整突变数据：
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 protein binding | • GO:0005634 nucleus |
| • GO:0005737 cytoplasm | • GO:0006366 transcription by RNA polymerase II |
| • GO:0006397 mRNA processing | • GO:0007165 signal transduction |
相关通路
• Pathway: 转录调控（Transcription regulation）
• Pathway: RNA代谢（RNA metabolism）
• Pathway: 神经退行性疾病通路（Neurodegenerative disease pathway）
蛋白质功能简介
ataxin-1蛋白由816个氨基酸组成，包含一个N端的Armadillo重复结构域和一个C端的polyglutamine tract（由CAG重复编码）。该蛋白主要定位于细胞核，参与转录调控和RNA加工。ataxin-1与多种蛋白相互作用，如Capicua（CIC）、SMRT等，形成转录抑制复合物。CAG重复扩增导致ataxin-1蛋白构象改变，形成不溶性聚集体，干扰正常功能并产生毒性，最终导致神经元死亡。
相关产品
| 产品名称 | 货号 | 物种 | 基因 ID | |
|---|---|---|---|---|
| ATXN1L基因敲除HEK293细胞 | EDJ-KQ12490 | 人 | 342371 | 详情 立即询价 |
| ATXN10基因敲除HEK293细胞 | EDJ-KQ8242 | 人 | 25814 | 详情 立即询价 |
| ATXN10基因敲除HCT116细胞 | EDJ-KQ34164 | 人 | 25814 | 详情 立即询价 |
| ATXN1L基因敲除HCT116细胞 | EDJ-KQ41457 | 人 | 342371 | 详情 立即询价 |
| ATXN10基因敲除A549细胞 | EDJ-KQ34163 | 人 | 25814 | 详情 立即询价 |
| ATXN1L基因敲除A549细胞 | EDJ-KQ41456 | 人 | 342371 | 详情 立即询价 |
| ATXN10基因敲除Hela细胞 | EDJ-KQ34165 | 人 | 25814 | 详情 立即询价 |
| ATXN1L基因敲除Hela细胞 | EDJ-KQ41458 | 人 | 342371 | 详情 立即询价 |
| ATXN1基因敲除HCT116细胞 | EDJ-KQ71351 | 人 | 6310 | 详情 立即询价 |
| ATXN1基因敲除A549细胞 | EDJ-KQ62885 | 人 | 6310 | 详情 立即询价 |
| ATXN1基因敲除HEK293细胞 | EDJ-KQ50609 | 人 | 6310 | 详情 立即询价 |
| ATXN1基因敲除Hela细胞 | EDJ-KQ54393 | 人 | 6310 | 详情 立即询价 |
Displaying Records 1 To 12 Of 12 Records
联系电话