ATXN2基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
ATXN2基因编码的Ataxin-2蛋白参与RNA代谢和应激颗粒形成,其异常扩增与多种神经退行性疾病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | ATXN2 |
|---|---|
| 基因全名 | Ataxin 2 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 12q24.12 |
| NCBI Gene ID | 6311 ncbi.nlm.nih.gov/gene/6311 |
| Ensembl ID | ENSG00000204842 |
| UniProt ID | Q99700 |
| OMIM ID | 601517 |
| HGNC ID | 10555 |
| 基因别名 | ATX2, SCA2, ASL13 |
基因功能与研究简介
ATXN2基因编码Ataxin-2蛋白,该蛋白含有PAM2基序和Lsm结构域,参与RNA代谢、应激颗粒形成和poly(A)结合蛋白相互作用。ATXN2基因的CAG三核苷酸重复扩增(正常范围通常为22-23次,致病性扩增通常超过34次)导致脊髓小脑性共济失调2型(SCA2),并与肌萎缩侧索硬化症(ALS)和帕金森病等疾病风险相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 脊髓小脑性共济失调2型(SCA2) | CAG重复扩增导致蛋白功能获得性毒性,引起小脑和脑干神经元变性 | 已明确致病(OMIM) |
| 肌萎缩侧索硬化症(ALS) | 中等长度CAG重复(通常为27-33次)增加ALS风险,可能通过影响RNA代谢和应激颗粒形成 | 具有较强研究证据(ClinVar, OMIM) |
| 帕金森病 | 中等长度CAG重复可能增加帕金森病风险,但证据尚不充分 | 潜在关联(ClinVar) |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 小脑 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 大脑皮层 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 脊髓 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 心脏 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| SH-SY5Y | 暂无可靠数据 | 神经母细胞瘤细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 胚胎肾细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| CAG重复扩增(>34次) | 三核苷酸重复扩增 | 罕见 | 功能获得性毒性,导致SCA2 |
| CAG重复中等长度(27-33次) | 三核苷酸重复扩增 | 约1-2%人群 | 增加ALS和帕金森病风险 |
| 错义突变(如P301L) | 点突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能,但致病性尚不明确 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
暂无明确证据表明ATXN2突变导致功能丧失。
Gain of Function(功能获得,GOF)
CAG重复扩增导致蛋白获得毒性功能,是SCA2的主要致病机制。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据支持ATXN2突变具有显性负效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003723 RNA binding | • GO:0005737 cytoplasm |
| • GO:0036464 cytoplasmic ribonucleoprotein granule | • GO:0044822 poly(A) RNA binding |
| • GO:0005634 nucleus |
相关通路
• Pathway: RNA metabolism
• Pathway: Stress granule formation
蛋白质功能简介
Ataxin-2蛋白由ATXN2基因编码,包含1313个氨基酸,分子量约140 kDa。蛋白含有PAM2基序,与poly(A)结合蛋白相互作用,参与mRNA的翻译调控和稳定性。Ataxin-2在应激条件下参与应激颗粒的形成,对细胞应激反应至关重要。CAG重复扩增导致蛋白构象改变,形成聚集体,干扰RNA代谢和应激颗粒动态,最终导致神经元功能障碍和死亡。
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