ATXN3基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
ATXN3基因编码去泛素化酶,其CAG重复扩增导致脊髓小脑性共济失调3型,是神经退行性疾病研究的重要靶点。
基因信息卡
| 基因符号 | ATXN3 |
|---|---|
| 基因全名 | Ataxin 3 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 14q21.1 |
| NCBI Gene ID | 4287 ncbi.nlm.nih.gov/gene/4287 |
| Ensembl ID | ENSG00000066427 |
| UniProt ID | P54252 |
| OMIM ID | 607047 |
| HGNC ID | 7106 |
| 基因别名 | ATX3, JOS, MJD, MJD1, SCA3 |
基因功能与研究简介
ATXN3基因编码ataxin-3蛋白,该蛋白是一种去泛素化酶,参与泛素-蛋白酶体系统调控、转录调控和自噬等过程。ATXN3基因的CAG三核苷酸重复扩增(正常范围12-44次,致病范围52-86次)导致脊髓小脑性共济失调3型(SCA3),又称马查多-约瑟夫病(MJD)。该病为常染色体显性遗传,主要表现为进行性小脑性共济失调、眼肌麻痹和锥体束征。ATXN3蛋白功能异常与神经元毒性、蛋白聚集和线粒体功能障碍相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 脊髓小脑性共济失调3型(SCA3) | CAG重复扩增导致ataxin-3蛋白获得毒性功能,形成聚集体,干扰神经元功能,导致小脑和脑干神经元变性。 | 已明确致病 |
| 马查多-约瑟夫病(MJD) | 与SCA3为同一疾病,由ATXN3基因CAG重复扩增引起,临床表现相似。 | 已明确致病 |
| 其他神经退行性疾病 | 部分研究提示ATXN3基因多态性可能影响帕金森病、阿尔茨海默病等风险,但证据尚不充分。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 小脑 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 大脑皮层 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 脑干 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 脊髓 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 心脏 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
| 骨骼肌 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| SH-SY5Y | 暂无可靠数据 | 神经母细胞瘤细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 人胚肾细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| CAG重复扩增(正常12-44次,致病52-86次) | 重复扩增 | 致病性变异 | 获得毒性功能,导致蛋白聚集和神经元功能障碍 |
| p.Asp19Ala (c.56A>C) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能,但临床意义未明确 |
| p.Arg154His (c.461G>A) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响去泛素化酶活性,但临床意义未明确 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
暂无明确证据表明ATXN3功能缺失导致疾病,但部分研究提示其去泛素化酶活性降低可能参与疾病机制。
Gain of Function(功能获得,GOF)
CAG重复扩增导致ataxin-3蛋白获得毒性功能,是SCA3的主要致病机制。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据支持ATXN3突变具有显性负效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0004843 (cysteine-type deubiquitinase activity) | • GO:0006511 (ubiquitin-dependent protein catabolic process) |
| • GO:0005634 (nucleus) | • GO:0005737 (cytoplasm) |
| • GO:0005829 (cytosol) | • GO:0005739 (mitochondrion) |
相关通路
• Ubiquitin-Proteasome System (UPS)
• Autophagy
• Mitochondrial dysfunction
蛋白质功能简介
ataxin-3蛋白由ATXN3基因编码,包含一个Josephin结构域(具有去泛素化酶活性)和两个泛素相互作用基序(UIM)。该蛋白参与去泛素化过程,调控多种底物的稳定性,并参与转录调控和自噬。在SCA3中,CAG重复扩增导致polyQ链延长,使ataxin-3蛋白易于聚集,形成神经元内包涵体,并通过干扰蛋白稳态、线粒体功能等途径导致神经毒性。
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