BAP1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

BAP1是一种肿瘤抑制基因,其突变与多种癌症及BAP1肿瘤易感综合征相关。

基因信息卡

基因符号 BAP1
基因全名 BRCA1 associated protein 1
基因类型 protein-coding
染色体位置 3p21.1
NCBI Gene ID 8314 ncbi.nlm.nih.gov/gene/8314
Ensembl ID ENSG00000163930
UniProt ID Q92560
OMIM ID 603089
HGNC ID 950
基因别名 UCHL2; hucep-6; FLJ35535

基因功能与研究简介

BAP1基因编码一种泛素羧基末端水解酶,属于去泛素化酶家族。该蛋白通过去泛素化多种底物,参与细胞增殖、凋亡、DNA损伤修复和基因转录调控等关键过程。BAP1作为肿瘤抑制因子,其功能丧失突变与多种恶性肿瘤的发生发展密切相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
BAP1肿瘤易感综合征 BAP1基因胚系突变导致该综合征,增加患间皮瘤、黑色素瘤、肾细胞癌等风险。 已明确致病
葡萄膜黑色素瘤 BAP1体细胞突变或缺失常见于葡萄膜黑色素瘤,与肿瘤进展和转移相关。 已明确致病
恶性间皮瘤 BAP1突变在恶性间皮瘤中高频发生,尤其在石棉暴露相关病例中。 已明确致病
肾细胞癌 BAP1突变与肾透明细胞癌的侵袭性和不良预后相关。 已明确致病
皮肤黑色素瘤 BAP1突变在部分皮肤黑色素瘤中检出,可能参与肿瘤发生。 具有较强研究证据
胆管癌 BAP1突变在肝内胆管癌中常见,可能作为驱动事件。 具有较强研究证据

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
皮肤 暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
A549 暂无可靠数据 肺癌细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1717delC (p.Leu573Trpfs*3) 移码突变 罕见 Loss of Function
c.2057A>G (p.Tyr686Cys) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能
c.1786C>T (p.Arg596*) 无义突变 罕见 Loss of Function
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

BAP1突变常导致蛋白功能丧失,包括移码、无义和剪接位点突变,导致截短蛋白或mRNA降解,从而丧失去泛素化酶活性,无法正常调控细胞增殖和凋亡。

Gain of Function(功能获得,GOF)

目前尚无明确证据表明BAP1存在功能获得性突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

部分错义突变可能产生显性负效应,干扰野生型BAP1的功能,但证据有限。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0004843 - thiol-dependent deubiquitinase • GO:0005634 - nucleus
• GO:0005654 - nucleoplasm • GO:0005737 - cytoplasm
• GO:0006281 - DNA repair • GO:0006915 - apoptotic process
• GO:0007049 - cell cycle • GO:0016567 - protein ubiquitination
• GO:0031625 - ubiquitin protein ligase binding • GO:0043161 - proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process

相关通路

hsa04120: Ubiquitin mediated proteolysis
hsa04210: Apoptosis
hsa05200: Pathways in cancer
hsa05235: PD-L1 expression and PD-1 checkpoint pathway in cancer

蛋白质功能简介

BAP1蛋白是一种去泛素化酶,包含UCH域、核定位信号和与BRCA1结合的RING finger域。它通过去泛素化组蛋白H2A和H2B等底物,参与基因转录调控、DNA损伤修复和细胞周期调控。BAP1与ASXL1/2等形成多蛋白复合物,发挥肿瘤抑制功能。

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