BARD1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
BARD1是BRCA1的关键结合伴侣,参与DNA损伤修复和肿瘤抑制,其突变与乳腺癌、卵巢癌风险相关。
基因信息卡
| 基因符号 | BARD1 |
|---|---|
| 基因全名 | BRCA1 associated RING domain 1 |
| 基因类型 | 蛋白编码基因 |
| 染色体位置 | 2q35 |
| NCBI Gene ID | 580 ncbi.nlm.nih.gov/gene/580 |
| Ensembl ID | ENSG00000138376 |
| UniProt ID | Q99728 |
| OMIM ID | 601593 |
| HGNC ID | 952 |
| 基因别名 | BRCA1-associated RING domain protein 1 |
基因功能与研究简介
BARD1(BRCA1 associated RING domain 1)基因编码一种与BRCA1相互作用的RING finger蛋白。BARD1与BRCA1形成异源二聚体,是BRCA1介导的DNA损伤修复、细胞周期检查点调控和转录调控所必需的。BARD1在维持基因组稳定性中发挥关键作用,其功能丧失与多种癌症风险增加相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 乳腺癌 | BARD1突变导致其与BRCA1的相互作用受损,影响DNA修复功能,增加基因组不稳定性,从而促进肿瘤发生。 | 已明确致病 |
| 卵巢癌 | BARD1突变与卵巢癌风险增加相关,机制与乳腺癌类似,通过影响BRCA1功能导致DNA修复缺陷。 | 已明确致病 |
| 子宫内膜癌 | BARD1突变可能增加子宫内膜癌风险,但证据相对较弱。 | 潜在关联 |
| 肺癌 | BARD1表达异常或突变可能与肺癌发生相关,但证据有限。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 乳腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 卵巢 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 脾脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| HCC1937 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系,BRCA1突变 |
| OVCAR3 | 暂无可靠数据 | 卵巢癌细胞系 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 人胚胎肾细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1690C>T (p.Arg564Cys) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响BARD1蛋白稳定性或与BRCA1的相互作用,导致功能部分丧失。 |
| c.1315C>T (p.Arg439Ter) | 无义突变 | 罕见 | 导致蛋白截短,功能丧失。 |
| c.1921C>T (p.Arg641Ter) | 无义突变 | 罕见 | 导致蛋白截短,功能丧失。 |
| c.1977C>A (p.Tyr659Ter) | 无义突变 | 罕见 | 导致蛋白截短,功能丧失。 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
BARD1的截短突变或错义突变导致蛋白功能丧失,影响DNA修复和肿瘤抑制功能。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明BARD1存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
部分错义突变可能产生显性负效应,干扰野生型BARD1与BRCA1的相互作用,但证据有限。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 protein binding | • GO:0003684 damaged DNA binding |
| • GO:0006281 DNA repair | • GO:0006974 cellular response to DNA damage stimulus |
| • GO:0005634 nucleus | • GO:0004842 ubiquitin-protein transferase activity |
相关通路
• Homologous recombination repair of double-strand breaks (BRCA1-BARD1 pathway)
• Fanconi anemia pathway
• p53 signaling pathway
蛋白质功能简介
BARD1蛋白包含N端RING finger结构域、两个锚蛋白重复结构域和C端BRCT结构域。RING finger结构域介导与BRCA1的异源二聚化,并具有E3泛素连接酶活性。BARD1与BRCA1共同参与DNA双链断裂的同源重组修复,并在细胞周期检查点调控中发挥作用。BARD1的缺失或突变导致DNA修复缺陷,增加基因组不稳定性,与多种癌症易感性相关。