BCR基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
BCR基因编码的蛋白质参与B细胞发育和信号转导,其与ABL1基因的融合是慢性髓性白血病的关键驱动因素。
基因信息卡
| 基因符号 | BCR |
|---|---|
| 基因全名 | BCR activator of RhoGEF and GTPase |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 22q11.23 |
| NCBI Gene ID | 613 ncbi.nlm.nih.gov/gene/613 |
| Ensembl ID | ENSG00000186716 |
| UniProt ID | P11274 |
| OMIM ID | 151410 |
| HGNC ID | 1014 |
| 基因别名 | ['BCR1', 'D22S11', 'FLJ16453', 'CML', 'PHL'] |
基因功能与研究简介
BCR基因编码一种多结构域蛋白,具有丝氨酸/苏氨酸激酶活性、RhoGEF(鸟苷酸交换因子)活性和GTPase激活蛋白(GAP)活性。该蛋白参与多种细胞过程,包括细胞生长、分化、粘附和凋亡。BCR基因最著名的功能是参与费城染色体(Philadelphia chromosome)易位,形成BCR-ABL融合基因,该融合基因是慢性髓性白血病(CML)和部分急性淋巴细胞白血病(ALL)的致病驱动因素。此外,BCR蛋白在B细胞发育和信号转导中发挥重要作用。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 慢性髓性白血病(CML) | BCR-ABL融合基因产生组成性激活的酪氨酸激酶,驱动白血病发生。 | 已明确致病 |
| 急性淋巴细胞白血病(ALL) | BCR-ABL融合基因(p190形式)与Ph阳性ALL相关。 | 已明确致病 |
| 急性髓性白血病(AML) | 罕见BCR-ABL融合,与AML相关。 | 具有较强研究证据 |
| 其他实体瘤 | BCR-ABL融合在少数实体瘤中报道,但证据有限。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 骨髓 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 脾脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 淋巴结 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| K562 | 暂无可靠数据 | BCR-ABL阳性细胞系 |
| HL-60 | 暂无可靠数据 | 髓系白血病细胞系 |
| Ramos | 暂无可靠数据 | Burkitt淋巴瘤细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| BCR-ABL融合 | 染色体易位t(9;22)(q34;q11) | CML中约95%患者阳性 | 产生组成性激活的酪氨酸激酶,驱动白血病 |
| BCR点突变 | 罕见 | 暂无明确频率 | 可能影响蛋白功能,但临床意义不明确 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
BCR基因的纯合失活突变在小鼠中导致中性粒细胞增多和B细胞发育缺陷,但人类中罕见。
Gain of Function(功能获得,GOF)
BCR-ABL融合基因是典型的gain of function突变,产生异常激活的酪氨酸激酶。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明BCR突变具有显性负效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0000166 | • GO:0004674 |
| • GO:0005085 | • GO:0005096 |
| • GO:0005515 | • GO:0005524 |
| • GO:0005737 | • GO:0005829 |
| • GO:0007165 | • GO:0007264 |
| • GO:0008283 | • GO:0016301 |
| • GO:0016740 | • GO:0035556 |
| • GO:0043065 | • GO:0045944 |
相关通路
• BCR-ABL signaling (KEGG: hsa05221)
• B cell receptor signaling pathway (KEGG: hsa04662)
• Rho GTPase cycle (Reactome: R-HSA-194840)
蛋白质功能简介
BCR蛋白是一种多结构域蛋白,包含N端的卷曲螺旋结构域、RhoGEF结构域、PH结构域、C2结构域和C端的GAP结构域。它作为RhoGEF激活Rac和Cdc42,作为GAP作用于Rac和Cdc42,调节细胞骨架重组和细胞迁移。BCR蛋白还参与B细胞受体信号通路,调节B细胞的发育和功能。在BCR-ABL融合蛋白中,BCR的N端部分与ABL的C端部分融合,导致ABL酪氨酸激酶活性组成性激活,促进细胞增殖和存活。