BDP1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

BDP1是RNA聚合酶III转录因子复合物的关键亚基,参与tRNA和5S rRNA的合成,其突变与智力障碍和听力损失相关。

基因信息卡

基因符号 BDP1
基因全名 BAP31 downstream neighbor 1
基因类型 protein-coding
染色体位置 5q13.2
NCBI Gene ID 55814 ncbi.nlm.nih.gov/gene/55814
Ensembl ID ENSG00000145779
UniProt ID Q9H8V3
OMIM ID 607016
HGNC ID 17449
基因别名 TFIIIB90, hTFIIIB90, BDP1, BDP

基因功能与研究简介

BDP1(BAP31 downstream neighbor 1)基因编码RNA聚合酶III转录因子复合物TFIIIB的90 kDa亚基。该蛋白是RNA聚合酶III介导的转录所必需的,负责合成tRNA、5S rRNA和其他小RNA。BDP1与BRF1和TBP形成复合物,在转录起始中发挥关键作用。BDP1的突变与神经发育障碍和听力损失相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
智力障碍 BDP1突变导致RNA聚合酶III转录缺陷,影响tRNA和5S rRNA合成,进而影响神经元功能。 已明确致病
听力损失 BDP1突变与常染色体隐性遗传性听力损失相关,可能通过影响内耳毛细胞中的蛋白质合成。 已明确致病
癌症 BDP1在多种癌症中表达异常,可能通过影响tRNA合成促进肿瘤发生,但具体机制尚不明确。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
内耳 暂无可靠数据 高表达
睾丸 暂无可靠数据 中等表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 常用细胞系
HeLa 暂无可靠数据 常用细胞系
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.2407C>T (p.Arg803Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.1568G>A (p.Arg523His) 错义突变 罕见 可能为Loss of Function
c.3319C>T (p.Arg1107Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

BDP1的截短突变(如无义突变)导致蛋白功能丧失,影响RNA聚合酶III转录,导致疾病。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明BDP1存在功能获得性突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明BDP1突变具有显性负效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003899 (RNA polymerase III activity) • GO:0006383 (transcription by RNA polymerase III)
• GO:0005667 (transcription factor complex) • GO:0005634 (nucleus)

相关通路

RNA polymerase III transcription (Reactome: R-HSA-76071)

蛋白质功能简介

BDP1蛋白是TFIIIB复合物的亚基,与BRF1和TBP相互作用,参与RNA聚合酶III启动子识别和转录起始。该蛋白包含多个WD40重复结构域,可能参与蛋白质-蛋白质相互作用。BDP1的亚细胞定位主要在细胞核。

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