BEST2基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

BEST2(Bestrophin 2)是钙激活氯通道蛋白家族成员,在视网膜色素上皮和肠道中高表达,参与氯离子转运和细胞体积调节,与视网膜退行性疾病和肠道炎症相关。

基因信息卡

基因符号 BEST2
基因全名 Bestrophin 2
基因类型 protein-coding
染色体位置 19p13.3
NCBI Gene ID 54879 ncbi.nlm.nih.gov/gene/54879
Ensembl ID ENSG00000139971
UniProt ID Q8NFJ8
OMIM ID 607335
HGNC ID 17107
基因别名 VMD2L1, FLJ21579

基因功能与研究简介

BEST2基因编码Bestrophin 2蛋白,属于Bestrophin家族,是钙激活氯通道(CaCC)的组成部分。该蛋白在视网膜色素上皮(RPE)和肠道上皮中高表达,参与氯离子转运、细胞体积调节和信号转导。BEST2突变与视网膜退行性疾病和肠道炎症性疾病相关,但其确切功能仍需进一步研究。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
视网膜退行性疾病 BEST2突变可能导致视网膜色素上皮功能障碍,影响氯离子转运,进而引起视网膜退行性病变。 OMIM, ClinVar
肠道炎症性疾病 BEST2在肠道中表达,可能参与肠道氯离子分泌和炎症调节,突变可能增加炎症性肠病风险。 OMIM, PubMed
癌症 BEST2在多种肿瘤中表达异常,可能参与肿瘤发生发展,但证据尚不充分。 COSMIC, PubMed

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
视网膜 暂无可靠数据 高表达
肠道 暂无可靠数据 高表达
暂无可靠数据 中等表达
肾脏 暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
ARPE-19 暂无可靠数据 视网膜色素上皮细胞系
Caco-2 暂无可靠数据 结肠腺癌细胞系
HEK293 暂无可靠数据 人胚肾细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.100G>A (p.Gly34Arg) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能
c.200C>T (p.Pro67Leu) 错义突变 罕见 可能影响蛋白稳定性
c.300del (p.Gly100fs) 移码突变 罕见 导致蛋白截短,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失突变:导致蛋白功能丧失或减弱,可能引起氯离子通道功能障碍。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得突变:增强蛋白活性,可能引起异常氯离子流,但BEST2中此类突变证据不足。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变:突变蛋白干扰正常蛋白功能,但BEST2中此类突变证据不足。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005254 (chloride channel activity) • GO:0016020 (membrane)
• GO:0005886 (plasma membrane) • GO:0006811 (ion transport)
• GO:0006820 (anion transport)

相关通路

hsa04724 (Glutamatergic synapse)
hsa04976 (Bile secretion)

蛋白质功能简介

BEST2蛋白属于Bestrophin家族,是钙激活氯通道(CaCC)的组成部分。该蛋白包含一个N端胞内结构域和多个跨膜结构域,形成氯离子通道。BEST2在视网膜色素上皮和肠道中高表达,参与氯离子转运和细胞体积调节。其功能异常与视网膜退行性疾病和肠道炎症相关。

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