BEST4基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

BEST4(Bestrophin 4)是钙激活氯离子通道蛋白家族成员,在肠道和视网膜中高表达,参与离子转运和细胞体积调节,与多种疾病相关。

基因信息卡

基因符号 BEST4
基因全名 bestrophin 4
基因类型 protein-coding
染色体位置 1p34.2
NCBI Gene ID 266675 ncbi.nlm.nih.gov/gene/266675
Ensembl ID ENSG00000143374
UniProt ID Q8N1M3
OMIM ID 607335
HGNC ID 17108
基因别名 FLJ20298, MGC126851

基因功能与研究简介

BEST4(Bestrophin 4)是bestrophin家族成员,编码一种钙激活氯离子通道蛋白。该蛋白在肠道、视网膜和脑等组织中表达,参与氯离子转运、细胞体积调节和膜电位稳定。BEST4突变与视网膜营养不良和胃肠道疾病相关,但其确切功能仍需进一步研究。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
视网膜营养不良 BEST4突变可能影响视网膜色素上皮细胞的功能,导致视网膜退行性病变。 OMIM
胃肠道疾病 BEST4在肠道高表达,可能参与肠道离子转运,突变与炎症性肠病等疾病相关。 ClinVar
癌症 BEST4在结直肠癌中表达异常,可能参与肿瘤发生发展。 COSMIC

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
小肠 暂无可靠数据 高表达
结肠 暂无可靠数据 高表达
视网膜 暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
Caco-2 暂无可靠数据 结直肠腺癌细胞系
HT-29 暂无可靠数据 结直肠腺癌细胞系
ARPE-19 暂无可靠数据 视网膜色素上皮细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.100C>T (p.Arg34Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.200A>G (p.Asp67Gly) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能
c.300del (p.Leu100fs) 移码突变 罕见 Loss of Function
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

无义突变、移码突变等导致蛋白功能丧失,可能引起疾病。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005220 (inositol 1 • 4
• 5-trisphosphate-sensitive calcium-release channel activity) • GO:0005254 (chloride channel activity)
• GO:0016020 (membrane) • GO:0005886 (plasma membrane)

相关通路

hsa04722 (Neurotrophin signaling pathway)
hsa04976 (Bile secretion)

蛋白质功能简介

BEST4蛋白属于bestrophin家族,具有钙激活氯离子通道活性。蛋白包含一个N端跨膜结构域和一个C端胞质结构域,可能形成五聚体复合物。BEST4在肠道和视网膜中高表达,参与氯离子转运和细胞体积调节。突变可能导致通道功能异常,进而引发疾病。

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