BHLHE23基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
BHLHE23(bHLHe23)是碱性螺旋-环-螺旋转录因子家族成员,参与神经发育和细胞分化调控,其突变与遗传性视网膜疾病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | BHLHE23 |
|---|---|
| 基因全名 | basic helix-loop-helix family member e23 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 20q13.33 |
| NCBI Gene ID | 128408 ncbi.nlm.nih.gov/gene/128408 |
| Ensembl ID | ENSG00000101210 |
| UniProt ID | Q8NDY8 |
| OMIM ID | 609761 |
| HGNC ID | 16134 |
| 基因别名 | BHLHB4, bHLHe23, Beta3a, Class E basic helix-loop-helix protein 23 |
基因功能与研究简介
BHLHE23(basic helix-loop-helix family member e23)基因编码一种碱性螺旋-环-螺旋转录因子,属于bHLH家族。该蛋白在神经发育中发挥重要作用,特别是在视网膜和中枢神经系统的分化过程中。BHLHE23通过形成同源或异源二聚体,结合E-box序列,调控下游靶基因的表达。研究表明,BHLHE23的突变与常染色体隐性遗传的视网膜色素变性(RP)和Leber先天性黑矇(LCA)相关。此外,BHLHE23在多种肿瘤中表达异常,可能参与肿瘤发生发展。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 视网膜色素变性 | BHLHE23基因突变导致蛋白功能丧失,影响视网膜感光细胞的发育和存活,从而引发视网膜色素变性。 | 已明确致病 |
| Leber先天性黑矇 | BHLHE23基因突变导致严重的视网膜发育异常,表现为先天性视力严重受损。 | 已明确致病 |
| 癌症 | BHLHE23在多种肿瘤中表达异常,可能通过调控细胞增殖和凋亡参与肿瘤发生,但具体机制尚不明确。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 视网膜 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| ARPE-19 | 暂无可靠数据 | 视网膜色素上皮细胞系 |
| SH-SY5Y | 暂无可靠数据 | 神经母细胞瘤细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.424C>T (p.Arg142Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.238G>A (p.Gly80Arg) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能 |
| c.589_590del (p.Leu197ValfsTer3) | 移码突变 | 罕见 | Loss of Function |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能丧失型突变,导致蛋白截短或降解,失去转录调控功能,是视网膜疾病的主要致病机制。
Gain of Function(功能获得,GOF)
目前暂无明确证据表明BHLHE23存在功能获得型突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
目前暂无明确证据表明BHLHE23存在显性负效应突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003677 (DNA binding) | • GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity) |
| • GO:0005634 (nucleus) | • GO:0006355 (regulation of transcription |
| • DNA-templated) | • GO:0007275 (multicellular organism development) |
| • GO:0045944 (positive regulation of transcription by RNA polymerase II) |
相关通路
• hsa04310 (Wnt signaling pathway)
• hsa04390 (Hippo signaling pathway)
• hsa05200 (Pathways in cancer)
蛋白质功能简介
BHLHE23蛋白属于bHLH转录因子家族,包含基本的DNA结合结构域和螺旋-环-螺旋二聚化结构域。该蛋白在视网膜和神经系统中高表达,参与调控细胞分化和发育。BHLHE23通过形成同源或异源二聚体,结合E-box序列(CANNTG),激活或抑制下游基因转录。其功能异常与视网膜色素变性等疾病密切相关。