BRAT1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

BRAT1基因编码BRCA1相关ATM激活因子1,参与DNA损伤修复和细胞周期调控,其突变与神经发育障碍及肿瘤发生相关。

基因信息卡

基因符号 BRAT1
基因全名 BRCA1-associated ATM activator 1
基因类型 蛋白编码基因
染色体位置 7p22.3
NCBI Gene ID 221927 ncbi.nlm.nih.gov/gene/221927
Ensembl ID ENSG00000106009
UniProt ID Q6PJG6
OMIM ID 614506
HGNC ID 21701
基因别名 BRAT1, C7orf27, FLJ10881

基因功能与研究简介

BRAT1基因编码BRCA1相关ATM激活因子1(BRAT1),该蛋白在DNA损伤应答中发挥重要作用,参与ATM介导的细胞周期检查点调控和DNA修复。BRAT1通过与BRCA1和ATM相互作用,促进ATM的激活,从而在DNA双链断裂修复中起关键作用。此外,BRAT1还参与维持基因组稳定性,其功能异常与神经发育障碍和肿瘤发生相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
致死性新生儿癫痫性脑病 BRAT1基因纯合或复合杂合突变导致功能丧失,影响DNA损伤修复和神经元发育,引起严重的神经发育障碍。 已明确致病
神经发育障碍伴小头畸形和肌张力障碍 BRAT1突变导致蛋白功能异常,影响脑发育和运动功能。 具有较强研究证据
癌症 BRAT1表达异常或突变可能影响DNA修复,增加基因组不稳定性,与多种癌症(如乳腺癌、肺癌)相关。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
睾丸 暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 常用细胞系
HeLa 暂无可靠数据 常用细胞系
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经母细胞瘤细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.244C>T (p.Arg82Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.802C>T (p.Arg268Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.1327dupA (p.Thr443AsnfsTer26) 移码突变 罕见 Loss of Function
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变,导致BRAT1蛋白截短或降解,丧失DNA损伤修复功能。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 (protein binding) • GO:0006974 (DNA damage response)
• GO:0006281 (DNA repair) • GO:0005654 (nucleoplasm)
• GO:0005737 (cytoplasm)

相关通路

hsa03440 (Homologous recombination)
hsa04110 (Cell cycle)

蛋白质功能简介

BRAT1蛋白包含一个BRCT结构域,该结构域常见于DNA损伤修复蛋白。BRAT1与BRCA1和ATM相互作用,促进ATM的磷酸化激活,从而启动细胞周期检查点和DNA修复。BRAT1还参与调控p53的稳定性,影响细胞凋亡和衰老。

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