BRD3基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

BRD3是BET家族成员,参与染色质重塑和基因转录调控,与多种癌症及发育障碍相关。

基因信息卡

基因符号 BRD3
基因全名 Bromodomain containing 3
基因类型 protein-coding
染色体位置 9q34.2
NCBI Gene ID 8019 ncbi.nlm.nih.gov/gene/8019
Ensembl ID ENSG00000103257
UniProt ID Q15059
OMIM ID 601541
HGNC ID 1105
基因别名 RING3L; ORFX

基因功能与研究简介

BRD3(Bromodomain containing 3)是BET(Bromodomain and Extra-Terminal)家族成员,包含两个溴结构域和一个末端结构域。BRD3通过识别乙酰化组蛋白赖氨酸残基,参与染色质重塑和基因转录调控。BRD3在多种组织中表达,尤其在造血细胞和神经系统中高表达。研究表明BRD3在细胞周期调控、炎症反应和肿瘤发生中发挥重要作用。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
BRD3-NUTM1融合基因相关肿瘤 BRD3与NUTM1基因融合形成融合蛋白,导致NUT癌基因过度表达,驱动肿瘤发生。 已明确致病
结直肠癌 BRD3表达异常与结直肠癌的发生发展相关,可能通过调控MYC等癌基因表达。 具有较强研究证据
乳腺癌 BRD3在乳腺癌中高表达,与不良预后相关,可能通过调控雌激素受体信号通路。 具有较强研究证据
神经发育障碍 BRD3突变与智力障碍和发育迟缓相关,但具体机制尚不明确。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
骨髓 暂无可靠数据 高表达
淋巴结 暂无可靠数据 高表达
暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 中等表达
肝脏 暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
K562 暂无可靠数据 白血病细胞系
HCT116 暂无可靠数据 结直肠癌细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
HEK293 暂无可靠数据 胚胎肾细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
BRD3-NUTM1融合 基因融合 罕见 产生融合蛋白,导致NUT癌基因过度表达,驱动肿瘤发生
p.R432C 错义突变 罕见 可能影响溴结构域功能,导致染色质结合异常
p.G550D 错义突变 罕见 可能影响蛋白稳定性,导致功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

BRD3功能丧失突变可能导致基因转录调控异常,与神经发育障碍相关。

Gain of Function(功能获得,GOF)

BRD3-NUTM1融合蛋白具有致癌功能,属于功能获得性突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明BRD3突变具有显性负效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003682 - chromatin binding • GO:0005515 - protein binding
• GO:0005634 - nucleus • GO:0006351 - transcription
• DNA-templated • GO:0006355 - regulation of transcription
• DNA-templated • GO:0042393 - histone binding

相关通路

hsa05200 - Pathways in cancer
hsa05210 - Colorectal cancer
hsa05224 - Breast cancer
hsa05166 - Human T-cell leukemia virus 1 infection

蛋白质功能简介

BRD3蛋白属于BET家族,包含两个N端溴结构域(BD1和BD2)和一个C端末端结构域(ET)。溴结构域特异性识别乙酰化组蛋白赖氨酸残基,介导BRD3与染色质的结合,从而调控基因转录。BRD3在细胞周期调控、炎症反应和肿瘤发生中发挥重要作用。BRD3-NUTM1融合蛋白是NUT癌基因的驱动因素,导致NUT蛋白过度表达,促进肿瘤发生。

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