BUD23基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

BUD23是核糖体RNA甲基转移酶,参与18S rRNA加工和核糖体小亚基组装,其功能异常与多种疾病相关。

基因信息卡

基因符号 BUD23
基因全名 BUD23 rRNA methyltransferase and ribosome maturation factor
基因类型 protein-coding
染色体位置 7q11.23
NCBI Gene ID 114049 ncbi.nlm.nih.gov/gene/114049
Ensembl ID ENSG00000106344
UniProt ID O43709
OMIM ID 615987
HGNC ID 16405
基因别名 WBSCR22, MGC141919

基因功能与研究简介

BUD23(BUD23 rRNA methyltransferase and ribosome maturation factor)编码一种S-腺苷甲硫氨酸依赖性甲基转移酶,属于SPOUT家族。该蛋白定位于核仁,参与18S rRNA的2'-O-核糖甲基化,是核糖体小亚基生物发生所必需的。BUD23还参与前rRNA加工和核糖体组装,其功能异常可能导致核糖体生物发生缺陷,进而影响细胞增殖和分化。研究表明,BUD23在多种癌症中表达异常,可能作为潜在的肿瘤标志物或治疗靶点。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
发育迟缓 BUD23单倍剂量不足可能影响核糖体功能,导致发育异常,但具体机制尚不明确。 暂无明确证据
癌症 BUD23在多种肿瘤中高表达,可能通过促进核糖体生物发生支持肿瘤细胞增殖。 具有较强研究证据
智力障碍 BUD23位于7q11.23区域,该区域缺失与Williams-Beuren综合征相关,但BUD23单倍剂量不足是否直接导致智力障碍尚需进一步研究。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 暂无可靠数据
甲状腺 暂无可靠数据 暂无可靠数据
肾上腺 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 暂无可靠数据
HEK293 暂无可靠数据 暂无可靠数据
K562 暂无可靠数据 暂无可靠数据
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1A>G (p.Met1Val) 错义突变 暂无可靠数据 可能影响蛋白翻译起始,导致功能丧失
c.100C>T (p.Arg34Trp) 错义突变 暂无可靠数据 可能影响甲基转移酶活性
c.200G>A (p.Arg67His) 错义突变 暂无可靠数据 可能影响蛋白稳定性
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变,如无义突变或移码突变,导致蛋白功能缺失,可能影响核糖体生物发生。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变,目前暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变,目前暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003723 (RNA binding) • GO:0008168 (methyltransferase activity)
• GO:0006364 (rRNA processing) • GO:0005730 (nucleolus)
• GO:0005634 (nucleus)

相关通路

Ribosome biogenesis (WP:WP138)
rRNA processing (Reactome: R-HSA-6791226)

蛋白质功能简介

BUD23蛋白由306个氨基酸组成,属于SPOUT甲基转移酶家族。它包含一个保守的SAM结合域和催化域,负责催化18S rRNA特定位置的2'-O-核糖甲基化。该蛋白主要定位于核仁,与核糖体蛋白和组装因子相互作用,参与核糖体小亚基的成熟。BUD23的甲基转移酶活性对于正确加工前体rRNA至关重要,其缺失会导致核糖体生物发生障碍。

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