C10orf90基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

C10orf90(FATS)是一种潜在的肿瘤抑制因子,在多种癌症中表达下调,参与细胞凋亡和细胞周期调控。

基因信息卡

基因符号 C10orf90
基因全名 chromosome 10 open reading frame 90
基因类型 protein-coding
染色体位置 10q26.13
NCBI Gene ID 118769 ncbi.nlm.nih.gov/gene/118769
Ensembl ID ENSG00000120063
UniProt ID Q6NS38
OMIM ID 暂无可靠数据
HGNC ID 26169
基因别名 FATS, bA345M1.1

基因功能与研究简介

C10orf90(chromosome 10 open reading frame 90),又称FATS(fragile site-associated tumor suppressor),是一种潜在的肿瘤抑制基因。该基因位于染色体10q26.13,编码一个含有411个氨基酸的蛋白质。研究表明,C10orf90在多种肿瘤中表达下调,可能通过调控细胞凋亡和细胞周期参与肿瘤抑制。其表达水平与某些癌症的预后相关,但具体功能机制仍在研究中。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
肝细胞癌 C10orf90表达下调与肝细胞癌的发生发展相关,可能通过影响细胞凋亡和增殖发挥作用。 较强研究证据
乳腺癌 C10orf90在乳腺癌中表达降低,可能作为肿瘤抑制因子参与乳腺癌的进展。 较强研究证据
结直肠癌 C10orf90表达下调与结直肠癌的恶性程度相关,可能作为预后标志物。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
肝脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
乳腺 暂无可靠数据 暂无可靠数据
结肠 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HepG2 暂无可靠数据 肝癌细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
HCT116 暂无可靠数据 结直肠癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1183A>G (p.Thr395Ala) SNV 暂无可靠数据 可能影响蛋白质功能,但具体影响未知
c.157C>T (p.Arg53Ter) Nonsense 暂无可靠数据 可能导致蛋白质截短,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变,如无义突变导致蛋白质截短,可能使C10orf90失去肿瘤抑制功能。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明C10orf90存在功能获得型突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明C10orf90存在显性负效应突变。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0006915 (apoptotic process) • GO:0007049 (cell cycle)
• GO:0005634 (nucleus)

相关通路

hsa04210 (Apoptosis)
hsa04110 (Cell cycle)

蛋白质功能简介

C10orf90蛋白(FATS)定位于细胞核,参与调控细胞凋亡和细胞周期。研究表明,C10orf90可能通过调节p53信号通路或直接作用于细胞周期调控因子来发挥肿瘤抑制功能。其表达下调与多种癌症的进展和不良预后相关。

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