C1orf216基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
C1orf216是一个功能尚未完全明确的基因,可能参与细胞凋亡和肿瘤发生,其突变与多种癌症相关。
基因信息卡
| 基因符号 | C1orf216 |
|---|---|
| 基因全名 | chromosome 1 open reading frame 216 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 1q25.3 |
| NCBI Gene ID | 127254 ncbi.nlm.nih.gov/gene/127254 |
| Ensembl ID | ENSG00000143183 |
| UniProt ID | Q5T1M5 |
| OMIM ID | 暂无可靠数据 |
| HGNC ID | HGNC:25146 |
| 基因别名 | FLJ32771 |
基因功能与研究简介
C1orf216(chromosome 1 open reading frame 216)是一个位于人类1号染色体q25.3区域的蛋白质编码基因。其编码的蛋白质功能尚未完全阐明,但已有研究表明其可能参与细胞凋亡、细胞增殖和肿瘤发生等过程。C1orf216在多种正常组织中表达,但在某些癌症中表达异常,提示其可能在肿瘤发生中发挥作用。目前,关于C1orf216的详细功能、调控机制及其在疾病中的具体作用仍需进一步研究。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 结直肠癌 | C1orf216在结直肠癌中表达下调,可能通过影响细胞凋亡和增殖参与肿瘤发生。 | 较强研究证据 |
| 肝细胞癌 | C1orf216在肝细胞癌中表达下调,与肿瘤进展和不良预后相关。 | 较强研究证据 |
| 乳腺癌 | C1orf216在乳腺癌中表达异常,可能作为潜在的肿瘤抑制因子。 | 潜在关联 |
| 肺癌 | C1orf216在肺癌中表达下调,可能参与肿瘤抑制。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 结肠 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 乳腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HCT116 | 暂无可靠数据 | 结直肠癌细胞系 |
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.123A>G (p.I41M) | 错义突变 | 暂无可靠数据 | 可能影响蛋白质功能 |
| c.456C>T (p.R152*) | 无义突变 | 暂无可靠数据 | 可能导致蛋白质截短,功能丧失 |
| c.789delA (p.K263fs) | 移码突变 | 暂无可靠数据 | 可能导致蛋白质截短,功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能丧失型突变,如无义突变和移码突变,可能导致蛋白质功能缺失,与肿瘤抑制功能丧失相关。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明C1orf216存在功能获得型突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明C1orf216存在显性负效应突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 (protein binding) | • GO:0005737 (cytoplasm) |
| • GO:0006915 (apoptotic process) |
相关通路
• hsa04210 (Apoptosis)
• hsa05200 (Pathways in cancer)
蛋白质功能简介
C1orf216编码的蛋白质由约300个氨基酸组成,含有多个磷酸化位点,可能参与信号转导。其亚细胞定位主要在细胞质中,可能参与凋亡调控。目前,该蛋白质的具体功能尚不明确,但研究表明其可能作为肿瘤抑制因子,在多种癌症中表达下调。