CACYBP基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

CACYBP(Calcyclin Binding Protein)是一种多功能蛋白,参与泛素-蛋白酶体降解、细胞周期调控和转录调控,与多种癌症和神经退行性疾病相关。

基因信息卡

基因符号 CACYBP
基因全名 Calcyclin Binding Protein
基因类型 protein-coding
染色体位置 1q25.1
NCBI Gene ID 27101 ncbi.nlm.nih.gov/gene/27101
Ensembl ID ENSG00000116133
UniProt ID Q9HB71
OMIM ID 606862
HGNC ID 30423
基因别名 SIP, GIG5, PNAS-107, RP23-32L15.1

基因功能与研究简介

CACYBP基因编码钙周期素结合蛋白(Calcyclin Binding Protein),该蛋白最初被鉴定为S100A6(calcyclin)的相互作用蛋白。CACYBP在多种组织中表达,参与多种细胞过程,包括泛素-蛋白酶体降解途径、细胞周期调控、转录调控和细胞分化。CACYBP作为E3泛素连接酶复合物的组成部分,可促进特定底物的泛素化降解,如β-catenin和p53。此外,CACYBP还参与微管动力学和细胞骨架重塑。研究表明,CACYBP在多种癌症中表达异常,与肿瘤发生发展相关,同时在神经退行性疾病中也观察到其表达变化。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
癌症 CACYBP在多种癌症中表达上调,可能通过调控β-catenin和p53等关键蛋白的降解,影响细胞增殖和凋亡,促进肿瘤发生发展。 较强研究证据
神经退行性疾病 CACYBP在阿尔茨海默病等神经退行性疾病中表达改变,可能参与tau蛋白的磷酸化调控和神经元凋亡。 潜在关联
暂无明确致病性突变 目前尚无CACYBP基因突变直接导致遗传性疾病的明确证据。 暂无明确证据

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
心脏 暂无可靠数据 中等表达
肝脏 暂无可靠数据 中等表达
肾脏 暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 中等表达
骨骼肌 暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
HEK293 暂无可靠数据 人胚胎肾细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
A549 暂无可靠数据 肺癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.123C>T (p.Arg41Cys) 错义突变 罕见 可能影响蛋白结构,功能影响未知
c.456G>A (p.Thr152Thr) 同义突变 罕见 无功能影响
c.789delC (p.Pro263LeufsTer5) 移码突变 罕见 可能导致蛋白截短,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变:导致CACYBP蛋白表达减少或功能缺失,可能影响泛素-蛋白酶体降解途径,导致底物积累,影响细胞周期和凋亡。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变:目前尚无明确证据表明CACYBP存在功能获得型突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变:目前尚无明确证据表明CACYBP存在显性负性突变。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 (protein binding) • GO:0006511 (ubiquitin-dependent protein catabolic process)
• GO:0005634 (nucleus) • GO:0005737 (cytoplasm)
• GO:0005813 (centrosome) • GO:0005829 (cytosol)
• GO:0007049 (cell cycle) • GO:0016567 (protein ubiquitination)
• GO:0030054 (cell junction) • GO:0043161 (proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process)

相关通路

Ubiquitin-Proteasome Pathway (R-HSA-983168)
Beta-catenin degradation pathway (R-HSA-195253)
p53 pathway (R-HSA-5633007)

蛋白质功能简介

CACYBP蛋白由228个氨基酸组成,分子量约26 kDa。该蛋白包含一个N端的泛素样结构域和一个C端的钙调蛋白结合结构域。CACYBP作为E3泛素连接酶复合物的底物识别亚基,参与多种底物的泛素化降解,如β-catenin、p53和S100A6。此外,CACYBP还通过与微管蛋白相互作用,参与细胞骨架的调控。CACYBP在细胞核和细胞质中均有分布,在细胞周期调控、转录调控和细胞分化中发挥重要作用。

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